Paketti: dnaclust (3-7 ja muut)

Links for dnaclust

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti dnaclust:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [dnaclust.sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Tagit: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C , Role: role::program, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin dnaclust liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

program options library for C
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc 6 (>= 13.1)

GNU standardi C -kirjasto, versio 3

Imuroi dnaclust

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
armhf	3-7 b3	101.2 kt	582.0 kt	[tiedostoluettelo]