[ Source: bitseq ]
Paketti: bitseq (0.7.5 dfsg-6)
Links for bitseq
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti bitseq:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Tim Booth (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data
BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.
Muut pakettiin bitseq liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc 6 (>= 5.2)
- GNU standardi C -kirjasto, versio 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Imuroi bitseq
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| armhf | 286.8 kt | 1,158.0 kt | [tiedostoluettelo] |