Paketti: eigensoft (8.0.0 dfsg-2 ja muut)
Links for eigensoft
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti eigensoft:
- [eigensoft_8.0.0 dfsg-2.dsc]
- [eigensoft_8.0.0 dfsg.orig.tar.xz]
- [eigensoft_8.0.0 dfsg-2.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [www.hsph.harvard.edu]
Samankaltaisia paketteja:
reduction of population bias for genetic analyses
The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.
Muut pakettiin eigensoft liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library
- tai libblas.so.3
- näennäispaketti, jonka toteuttaa libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgsl28 (>= 2.8 dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
-
- dep: liblapack3
- Library of linear algebra routines 3 - shared version
- tai liblapack.so.3
- näennäispaketti, jonka toteuttaa liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: liblapacke (>= 3.12.0)
- Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
-
- dep: perl
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- rec: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
Imuroi eigensoft
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
armel | 8.0.0 dfsg-2 b1 | 406.4 kt | 3,585.0 kt | [tiedostoluettelo] |