[ Source: gmap ]
Paketti: gmap (2024-11-20 ds-1)
Links for gmap
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti gmap:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Shaun Jackman (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Alexandre Mestiashvili (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [research-pub.gene.com]
Samankaltaisia paketteja:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
Muut pakettiin gmap liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, sh4]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: perl
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi gmap
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 5,237.3 kt | 44,707.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 33,744.7 kt | 268,822.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 6,859.2 kt | 61,266.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armel | 4,930.9 kt | 46,231.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armhf | 4,950.9 kt | 44,107.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| i386 | 5,170.3 kt | 46,587.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 5,924.4 kt | 57,816.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 7,139.9 kt | 63,634.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 | 6,368.6 kt | 59,310.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sh4 (epävirallinen siirros) | 5,781.5 kt | 48,641.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| x32 (epävirallinen siirros) | 5,523.9 kt | 48,079.0 kt | [tiedostoluettelo] |