Paketti: maq (0.7.1-9)

Links for maq

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti maq:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [maq.sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c , implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Need an extra tag, Analysing, use::comparing, use::searching, Supports Format: Need an extra tag, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Muut pakettiin maq liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ei amd64, armel, armhf, s390x]
dep: libstdc 6 (>= 5)

GNU standardi C -kirjasto, versio 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi maq

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	295.7 kt	543.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	286.7 kt	519.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	285.5 kt	530.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	286.9 kt	474.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	306.2 kt	575.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	296.9 kt	578.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	303.5 kt	577.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	304.8 kt	647.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	288.4 kt	547.0 kt	[tiedostoluettelo]