Paketti: ggd-utils (1.0.0 ds-1 ja muut)

Links for ggd-utils

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti ggd-utils:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Muut pakettiin ggd-utils liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

Imuroi ggd-utils

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.0.0 ds-1 b6	1,775.3 kt	5,126.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0.0 ds-1 b6	1,530.8 kt	4,842.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0.0 ds-1 b6	1,515.0 kt	4,907.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0.0 ds-1 b6	1,507.8 kt	4,883.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0.0 ds-1 b6	1,651.4 kt	4,956.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0.0 ds-1 b6	1,379.6 kt	5,565.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1.0.0 ds-1 b6	1,412.2 kt	5,462.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0.0 ds-1 b6	1,497.5 kt	4,905.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0.0 ds-1 b6	1,619.4 kt	5,246.0 kt	[tiedostoluettelo]