Paket: ray (2.3.1-9)

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Externe Ressourcen:

Homepage [denovoassembler.sourceforge.net]

De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle   taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC Support-Bibliothek
dep: libmpich12 (>= 4.2.1)

Shared libraries for MPICH
dep: libstdc 6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C -Bibliothek (Version 3)
dep: mpi-default-bin

Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	746,9 kB	2.136,0 kB	[Liste der Dateien]