Paket: r-bioc-tximport (1.32.0 dfsg-1)

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Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

transcript-level estimates for biological sequencing

Imports transcript-level abundance, estimated counts and transcript lengths, and summarizes into matrices for use with downstream gene-level analysis packages. Average transcript length, weighted by sample-specific transcript abundance estimates, is provided as a matrix which can be used as an offset for different expression of gene-level counts.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-tximport

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.19

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.11.6)

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
sug: r-bioc-edger

Empirische Analyse von digitalen Genexpressionsdaten mit R
sug: r-bioc-limma

linear models for microarray data
sug: r-bioc-rhdf5

BioConductor HDF5 interface to R
sug: r-bioc-tximportdata

GNU R various transcript abundance quantifiers
sug: r-cran-jsonlite

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-matrix

GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen
sug: r-cran-matrixstats

GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix
sug: r-cran-readr (>= 0.2.2)

GNU R package to read rectangular text data
sug: r-cran-rmarkdown

Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate
sug: r-cran-testthat

GNU R testsuite

r-bioc-tximport herunterladen

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