Paket: r-bioc-deseq2 (1.44.0 dfsg-1 und andere)

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Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-deseq2

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dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.29) [nicht alpha, ia64, riscv64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht hppa, ia64, sh4]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

Laufzeitbibliothek für GNU-Fortran-Anwendungen
dep: liblapack3

Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

oder liblapack.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc 6 (>= 13.1) [hppa, ia64, sh4]

GNU-Implementierung der Standard-C -Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc 6 (>= 14) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

dep: libstdc 6 (>= 9) [x32]
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-bioc-3.19 [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
dep: r-bioc-biobase [hppa, ia64, sh4, x32]

base functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]

generic functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5) [hppa, ia64, sh4, x32]
dep: r-bioc-biocparallel [hppa, ia64, sh4, x32]

BioConductor facilities for parallel evaluation

dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
dep: r-bioc-geneplotter [x32]

R package of functions for plotting genomic data
dep: r-bioc-genomicranges [hppa, ia64, sh4, x32]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
dep: r-bioc-iranges [hppa, ia64, sh4, x32]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
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S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.16.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18) [hppa, ia64, sh4, x32]

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dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
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sug: r-bioc-glmgampoi [hppa, ia64, sh4, x32]

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sug: r-bioc-glmgampoi (>= 1.16.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
sug: r-bioc-tximeta [hppa, ia64, sh4, x32]

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sug: r-bioc-tximeta (>= 1.22.1) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
sug: r-bioc-tximport [hppa, ia64, sh4, x32]

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sug: r-bioc-tximport (>= 1.32.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
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sug: r-bioc-tximportdata (>= 1.32.0) [nicht hppa, ia64, sh4, x32]
sug: r-cran-biocmanager

access the Bioconductor project package repository
sug: r-cran-knitr

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GNU R testsuite

r-bioc-deseq2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.44.0 dfsg-1	1.245,5 kB	1.752,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.44.0 dfsg-1	1.253,3 kB	1.740,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.44.0 dfsg-1	1.240,1 kB	1.752,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.42.1 dfsg-1	1.234,4 kB	1.718,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.42.1 dfsg-1	1.254,7 kB	1.916,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.44.0 dfsg-1	1.243,4 kB	1.760,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.44.0 dfsg-1	1.254,1 kB	1.820,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.44.0 dfsg-1	1.253,4 kB	1.816,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.44.0 dfsg-1	1.251,0 kB	1.687,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.44.0 dfsg-1	1.254,1 kB	1.748,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.42.1 dfsg-1	1.256,3 kB	1.738,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.44.0 dfsg-1	1.236,9 kB	2.526,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.38.3 dfsg-1	1.258,9 kB	1.736,0 kB	[Liste der Dateien]