Paket: altree (1.3.2-2 und andere)

Links für altree

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket altree herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Charles Plessy (QS-Seite)
Vincent Danjean (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [gitlab.inria.fr]

Programm zur Phylogenie-basierten Assoziations- und Lokalisierungsanalyse

ALTree wurde für entworfen, um Assoziationen zu entdecken und Suszeptibilitäts-Lokuse (susceptibility loci) mittels phylogenetischen Bäumen aus Haplotypen zu lokalisieren. Zum Einen ermöglicht sie die Entdeckung einer Assoziation zwischen einem untersuchten Gen und einer Krankheit, zum Anderen wird eine Hypothese über Suszeptibilitäts-Lokuse möglich.

Markierungen: Software-Entwicklung: Perl-Entwicklung, Bibliotheken, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Rolle: Entwicklungs-Bibliothek, role::program, role::shared-lib, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Analyse, use::comparing, works-with-format::TODO, Unterstützt Formate: Reiner Text, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu altree

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgsl28 (>= 2.8 dfsg)

GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
dep: libmath-tamuanova-perl

Perl extension for the tamuanova library
dep: perl (>= 5.40.0-6)

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
dep: perlapi-5.40.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch perl-base

rec: libopenblas0

Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

oder libblis4

BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

oder libmkl-rt

Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

sug: altree-examples

Beispieldateien für ALTree

altree herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	1.3.2-2 b4	337,5 kB	565,0 kB	[Liste der Dateien]