Package: prime-phylo (1.0.11-9 and others)

Links for prime-phylo

Debian Resources:

Download Source Package prime-phylo:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Erik Sjolund (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [prime.sbc.su.se]

Similar packages:

Bayesiansk estimation af gentræer der tager højde for artstræet

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) er en pakke, der understøtter slutning af evolutionære parametre i en bayesiansk ramme ved hjælp af Markov-kædens Monte Carlo-simulering. Et kendetegn ved PriME er, at artstræet tages i betragtning ved analyse af gentræer.

Inddataene for PrIME er en flersekvenssammenligning i formatet FASTA og resultatet indeholder træer i formatet Newick.

Other Packages Related to prime-phylo

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libblas3

Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

or libblas.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0)

C -grænseflade til Message Passing Interface (MPI)
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)

Serialiseringsbibliotek for C
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: liblapack3

Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

or liblapack.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
dep: libstdc 6 (>= 9)

GNU Standard C bibliotek v3
dep: libxml2 (>= 2.7.4)

XML-bibliotek til GNOME
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

sug: mafft

Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
sug: mrbayes

Bayesiansk inferens for fylogeni
sug: muscle

Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
sug: njplot

Fylogenetisk trætegningsprogram
sug: phyml

Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
sug: probalign

Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder
sug: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
sug: raxml

Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
sug: treeviewx

Viser og udskriver fylogenetiske træer

Download prime-phylo

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.11-9 b1	802.3 kB	3,138.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.11-9 b1	719.1 kB	2,938.0 kB	[list of files]
armel	1.0.11-9 b1	676.5 kB	2,527.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.11-9 b1	689.1 kB	2,007.0 kB	[list of files]
i386	1.0.11-9 b1	867.4 kB	3,131.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.11-9 b1	685.2 kB	3,519.0 kB	[list of files]
mipsel	1.0.11-9 b1	689.8 kB	3,245.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.11-9 b1	810.2 kB	3,882.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.11-9 b1	717.4 kB	3,170.0 kB	[list of files]