Package: r-bioc-biomart (2.54.0 dfsg-1)
Links for r-bioc-biomart
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-biomart:
- [r-bioc-biomart_2.54.0 dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-biomart_2.54.0 dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-biomart_2.54.0 dfsg-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)
I de senere år er en rigdom af biologiske data blevet tilgængelige i offentlige dataarkiver. Nem adgang til disse værdifulde dataressourcer og sikker integration med dataanalyse er krævet for omfattende dataanalyse indenfor bioinformatik. BiomaRt tilbyder en grænseflade til en voksende samling af databaser, der implementerer programpakken BioMart (http://www.biomart.org). Pakken aktiverer indhentelse af store mængder data på en ensartet måde uden behov for at kende de underliggende databaseskemaer eller skrive komplekse SQL-forespørgsler. Eksempler på BioMart-databaser er Ensembl, COSMIC, Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase og dbSNP oversat til Ensembl. Disse væsentlige databaser giver biomaRt-brugere direkte adgang til et bredt sæt af data og aktiverer en bred vifte af funktionsrige forespørgsler fra gen-annotation til databaseundersøgelser.
Other Packages Related to r-bioc-biomart
|
|
|
|
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- dep: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor
-
- dep: r-bioc-biocfilecache
- GNU R management of files across sessions
-
- dep: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
-
- dep: r-cran-httr
- GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP
-
- dep: r-cran-progress
- GNU R - statusbjælker for terminalen
-
- dep: r-cran-rappdirs
- GNU R application directories
-
- dep: r-cran-stringr
- Gør det nemmere at arbejde med strenge
-
- dep: r-cran-xml (>= 3.99-0.7)
- GNU R-pakke for XML-fortolkning og oprettelse
-
- dep: r-cran-xml2
- GNU R XML-fortolker
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- sug: r-cran-mockery
- mocking library for GNU R
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-testthat
- GNU R-testpakke
-
- sug: r-cran-webmockr
- GNU R stubbing and setting expectations on 'HTTP' requests
Download r-bioc-biomart
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 431.8 kB | 628.0 kB | [list of files] |