Package: r-bioc-rgsepd (1.30.0-1)

Links for r-bioc-rgsepd

Debian Resources:

Download Source Package r-bioc-rgsepd:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioconductor.org]

Similar packages:

GNU R - gensætberigelse/projektionsvisninger

R/GSEPD er en bioinformatics-pakke for R til at hjælpe med at utvetydige transkriptomprøver (en matrix af RNA-Seq-tal ved transskriptions-id"er) ved at automatisere differentielt udtryk (med DESeq2), derefter gensætberigelse (med GOSeq), og til sidst en N-dimensionel projektion for at kvantificere, på hvilke måder hver prøve er som hver behandlingsgruppe.

Other Packages Related to r-bioc-rgsepd

depends

recommends

suggests

enhances

dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor
dep: r-bioc-biomart

GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)
dep: r-bioc-deseq2

R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
dep: r-bioc-go.db

Annotationskort der beskriver hele genontologien
dep: r-bioc-goseq (>= 1.28)

GNU r-genontologianalyseprogram for RNA-seq og andre længdeforstyrrede data
dep: r-bioc-org.hs.eg.db

Genom-bred annotation for mennesker
dep: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor - assay-container
dep: r-cran-gplots

GNU R-pakke med værktøjer for plot af data af Greg Warnes m.fl.

sug: r-bioc-biocgenerics

Generiske funktioner for Bioconductor
sug: r-cran-boot

GNU R-pakke for bootstrapping-funktioner fra Davison og Hinkley
sug: r-cran-knitr

GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
sug: r-cran-xtable

Gennemtvinger omdannelse af GNU R-data til tabeller i LaTex og HTML

Download r-bioc-rgsepd

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,311.4 kB	1,417.0 kB	[list of files]