Package: dialign-tx (1.0.2-14 and others)

Links for dialign-tx

Debian Resources:

Download Source Package dialign-t:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [dialign-tx.gobics.de]

Similar packages:

Segmentové uspořádání násobných sekvencí

DIALIGN-TX je nástroj pro příkazovou řádku umožňující provádět alignmenty několika proteinových nebo DNA sekvencí. Je to úplně přepsaná implementace segmentového přístupu s několika vylepšeními a heuristikou, což výrazně zvyšuje kvalitu výsledných aligmentů v porovnání s DIALIGN 2.2 a DIALIGN T. Pro párové alignmenty používá algoritmus "řetězení fragmentů" (fragment chaining), který upřednostňuje řetězce lokálních alignmentů s nízkým skóre před jednotlivými fragmenty s vysokým skóre. Pro násobné alignmenty DIALIGN-TN používá vylepšený "hladový postup" (greedy procedure), který není tak citlivý na nepodstatné lokální podobnosti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

depends

recommends

suggests

enhances

dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-14)

Segment-based multiple sequence alignment (data files)
dep: libc6 (>= 2.33) [not amd64]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Download dialign-tx

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.2-14 b1	84.6 kB	218.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.2-14	85.7 kB	192.0 kB	[list of files]
armel	1.0.2-14	67.9 kB	184.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.2-14	63.2 kB	136.0 kB	[list of files]
i386	1.0.2-14	75.8 kB	204.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.2-14	99.4 kB	248.0 kB	[list of files]
mipsel	1.0.2-14	89.4 kB	215.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.2-14	92.1 kB	213.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.2-14	71.2 kB	200.0 kB	[list of files]