Пакет: bowtie (1.3.0 dfsg1-1)

Връзки за bowtie

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник bowtie.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [bowtie-bio.sourceforge.net]

Подобни пакети:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c , interface::commandline, Role: Program, Наука: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с bowtie

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.27)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libstdc 6 (>= 9)

GNU Standard C Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

compression library - runtime

sug: bowtie-examples

Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

Изтегляне на bowtie

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1 599,8 кБ	6 884,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1 232,5 кБ	6 048,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1 066,9 кБ	7 862,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1 392,5 кБ	8 020,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1 312,7 кБ	6 768,0 кБ	[списък на файловете]