이 총장은 이와 함께 이날 오전 이창수 서울중앙지검장으로부터 도이치모터스 주가조작과 명품 가방 수수 의혹과 관련해 김 여사를 조사한 경위를 보고받았다. 이 총장은 이 자리에서 김 여사를 검찰청사가 아닌 대통령 경호처 관리하의 부속 청사에서 조사한 점을 강하게 질책한 것으로 알려졌다. 또 총장의 수사지휘권 배제 상태를 고려하더라도 현직 대통령의 배우자 소환조사라는 사안의 민감성을 고려할 때 대검찰청에 조사 일정조차 사전에 보고되지 않은 점도 지적했다고 한다. 이 지검장은 이 총장의 수사 지휘권이 배제된 도이치모터스 주가조작 의혹 조사가 끝난 뒤 명품가방 수수 의혹 조사가 시작돼 보고가 늦어진 사정 등을 설명하면서 여러 차례 이 총장에게 사과한 것으로 전해졌다.
이 총장은 대검 감찰부에 진상 파악 지시를 내렸다. 다만 이는 사실관계를 확인하는 차원으로, 이 지검장을 상대로 감찰에 착수한 단계는 아니라고 대검은 설명했다. 이 총장은 그간 공정성 시비가 불거지지 않도록 김 여사를 다른 피의자들과 마찬가지로 검찰청사로 소환해야 함을 수사팀에 여러 차례 강조했다.
서울중앙지검 수사팀은 지난 20일 김 여사를 정부 보안청사로 소환해 조사했다. 서울중앙지검이 이 사실을 조사를 시작한 지 10시간가량 지나서야 이 총장에게 통보한 것이 알려져 ‘총장 패싱 논란’이 일었다. 이 총장은 크게 화를 내며 거취와 관련한 언급까지 주변에 한 것으로 알려졌다.