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FMR1

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FMR1
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PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2BKD, 2FMR, 2LA5, 2QND, 4OVA, 4QVZ, 4QW2, 5DE5, 5DE8, 5DEA

識別子
記号FMR1, FMRP, FRAXA, POF, POF1, fragile X mental retardation 1, FMRP translational regulator 1, fragile X messenger ribonucleoprotein 1
外部IDOMIM: 309550 MGI: 95564 HomoloGene: 1531 GeneCards: FMR1
遺伝子の位置 (ヒト)
X染色体
染色体X染色体[1]
X染色体
FMR1遺伝子の位置
FMR1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点147,911,919 bp[1]
終点147,951,125 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
X染色体 (マウス)
染色体X染色体 (マウス)[2]
X染色体 (マウス)
FMR1遺伝子の位置
FMR1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点67,722,147 bp[2]
終点67,761,569 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 protein homodimerization activity
poly(U) RNA binding
ribosome binding
poly(G) binding
血漿タンパク結合
protein heterodimerization activity
核酸結合
translation initiation factor binding
mRNA結合
G-quadruplex RNA binding
RNA strand annealing activity
siRNA binding
miRNA binding
mRNA 3'-UTR binding
mRNA 5'-UTR binding
translation repressor activity
microtubule binding
クロマチン結合
methylated histone binding
sequence-specific mRNA binding
transmembrane transporter binding
RNA stem-loop binding
dynein complex binding
RNA結合
identical protein binding
translation regulator activity
細胞の構成要素 細胞質
axon terminus
樹状突起スパイン
核質
SMN complex
mRNA cap binding complex
樹状突起
核小体
neuron projection
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
細胞核
polysomal ribosome
細胞体
perinuclear region of cytoplasm
リボ核タンパク質
シナプス後肥厚
chromocenter
神経繊維
細胞結合
neuronal ribonucleoprotein granule
filopodium tip
postsynaptic membrane
ポリリボソーム
カハール体
染色体
成長円錐
セントロメア
growth cone filopodium
viral replication complex
細胞膜
extrinsic component of plasma membrane
glial cell projection
cell projection

dendritic filopodium
presynaptic membrane
presynapse
postsynapse
シナプス
細胞質基質
messenger ribonucleoprotein complex
ストレス顆粒
リボ核タンパク質顆粒
soma
dendritic spine neck
axon cytoplasm
生物学的プロセス negative regulation of translational initiation
regulation of dendritic spine development
positive regulation of intracellular transport of viral material
cellular response to virus
RNAスプライシング
regulation of gene silencing by miRNA
cellular response to hydroxyurea
regulation of neurotransmitter secretion
positive regulation of gene silencing by miRNA
神経系発生
cellular response to DNA damage stimulus
遺伝子サイレンシング
mRNA processing
mRNA transport
positive regulation of proteasomal protein catabolic process
viral process
regulation of mRNA stability
positive regulation of response to DNA damage stimulus
positive regulation of dendritic spine development
regulation of filopodium assembly
negative regulation of cytoplasmic translation
regulation of translation
regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
regulation of neuronal action potential
positive regulation of mRNA binding
cellular response to UV
modulation by host of viral RNA genome replication
glutamate receptor signaling pathway
negative regulation of long-term synaptic depression
positive regulation of filopodium assembly
negative regulation of synaptic vesicle exocytosis
positive regulation of receptor internalization
negative regulation of voltage-gated calcium channel activity
positive regulation of translation
negative regulation of mRNA catabolic process
輸送
positive regulation of protein phosphorylation
中枢神経系発生
順行性軸索輸送
negative regulation of translation
regulation of dendrite morphogenesis
regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission
regulation of modification of synaptic structure
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001185075
NM_001185076
NM_001185081
NM_001185082
NM_002024

NM_001290424
NM_008031
NM_001374719

RefSeq
(タンパク質)

NP_001172004
NP_001172005
NP_001172010
NP_001172011
NP_002015

n/a

場所
(UCSC)
Chr X: 147.91 – 147.95 MbChr X: 67.72 – 67.76 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
X染色体上のFMR1の位置

FMR1(fragile X mental retardation 1)は、FMRP(fragile X mental retardation protein)と呼ばれるタンパク質をコードするヒトの遺伝子である[5][6]。FMRPは脳に最も一般的に存在し、正常な認知発達英語版と女性の生殖機能に必要不可欠である。この遺伝子の変異は脆弱X症候群知的障害早発卵巣不全英語版自閉症パーキンソン病、発達遅滞や他の認知障害を引き起こす[7]FMR1前変異英語版(premutation)と関係した広範囲にわたる臨床表現型は、世界中で200万人以上に影響を与えている[8]

機能

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シナプス可塑性

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FMRPは神経のさまざまな領域で多様な機能を果たしているが、その機能は十分には特徴づけられてはいない。FMRPはmRNAの核細胞質間輸送、樹状突起へのmRNAの局在、シナプスでのタンパク質合成に関与することが示唆されている[9]。脆弱X症候群の研究によるFMRPの喪失時の影響を観察は、FMRPの機能の理解を助けてきた。脆弱X症候群のマウスモデルからは、FMRPがシナプス可塑性英語版に関与していることが示唆されている[10]。シナプスの可塑性には、シナプス受容体の活性化に応答して新たなタンパク質合成が行われることが必要である。刺激に応答したタンパク質合成はシナプスの恒久的な物理的変化とシナプス連結の変化を可能にし、学習や記憶の過程と関連していると考えられている。

グループI代謝型グルタミン酸受容体(mGluR)を介したシグナル伝達は、FMRP依存的なシナプス可塑性に重要な役割を果たしていることが示唆されている。シナプス後のmGluRの刺激は、セカンドメッセンジャーを介してタンパク質合成をアップレギュレーションする[11]。mGluRがシナプス可塑性に関与していることは、mGluRの刺激後に樹状突起スパインの伸長が観察されることからも示されている[12]。さらに、mGluRの活性化はシナプス近傍でのFMRPの合成を引き起こす。合成されたFMRPはmGluRの刺激後にポリソームと結合することから、FMRPが翻訳過程に関与していることが提唱されている。ここからさらに、FMRPはシナプスでのタンパク質合成とシナプス結合の成長に関与しているという主張がなされている[13]。FMRPの喪失は樹状突起スパインの異常な表現型を引き起こす。具体的には、マウス標本におけるFMR1遺伝子の欠失はスパインのシナプス数の増加を引き起こす[14]

翻訳における役割

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FMRPの役割として、翻訳の負の調節因子としてシナプス可塑性に影響を与えることが提唱されている。FMRPはRNA結合タンパク質であり、ポリソームと結合する[13][15]。FMRPのRNA結合能は、KHドメインとRGGボックスに依存している。KHドメインは多くのRNA結合タンパク質を特徴づける、保存されたモチーフである。このドメインの変異によって、FMRPのRNAへの結合能は損なわれる[16]

FMRPはmRNAの翻訳を阻害することが示されている。FMRPの変異によって、野生型FMRPが有する翻訳抑制能は失われる[17]。上述したように、mGluRの刺激はFMRPのタンパク質レベルの増加と関係している。さらに、mGluRの刺激はFMRPの標的mRNAのレベルの増加も引き起こす。FMRP欠損マウスでは、こうした標的mRNAにコードされるタンパク質の基底レベルが大きく上昇し、適切な調節が行われなくなることが明らかにされている[18]

FMRPによる翻訳抑制は、翻訳開始過程の阻害によって行われる。FMRPはCYFIP1英語版と結合し、続いて翻訳開始因子eIF4Eに結合する。FMRP-CYFIP1複合体はeIF4E依存的な翻訳を阻害することで、翻訳の抑制因子として作用する[19]。脆弱X症候群で観察される表現型である、標的の過剰なタンパク質レベルと翻訳制御の低下はFMRPによる翻訳抑制の喪失によって説明される可能性がある[19][20]。FMRPは多数の標的mRNAの翻訳を制御することが知られているが、FMRPによる翻訳制御の程度は未知である。FMRPはシナプスで標的mRNAの翻訳を抑制することが示されており、その標的にはArc/Arg3.1MAP1B英語版といった細胞骨格タンパク質やCaMKIIが含まれる[21]

FMRPによる翻訳制御はmGluRを介したシグナル伝達によって調節されることが示されている。mGluRの刺激は、シナプスでの局所的タンパク質合成のためのmRNA複合体の輸送を引き起こす。FMRPを含む粒子は樹状突起においてMAP1BのmRNAやrRNAと局在することが示されており、局所的タンパク質合成のためにこうしたFMRP-RNA複合体全体として樹状突起へ輸送される必要があることが示唆されている。さらに、FMRPのmGluR依存的な樹状突起への輸送には微小管が必要であることが明らかにされている[9]。FMRPはmRNAの積み荷と微小管との結合を補助することで、局所的タンパク質合成にさらなる役割を有している可能性がある[22]。このように、FMRPは輸送効率を調節することができるとともに、輸送中の翻訳を抑制することができる。FMRPの合成、ユビキチン化タンパク質分解はmGluRシグナル伝達に応答して迅速に行われ、翻訳の調節因子として極めて動的な役割を果たしていることが示唆される[18]

遺伝子発現

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FMR1遺伝子はX染色体に位置し、CGGトリヌクレオチドリピート(三塩基反復)を含んでいる。大部分の人々のFMR1遺伝子では、CGGセグメントのリピートは5–44回である。CGGセグメントのリピート数の多さは認知機能や生殖機能の異常と関係している。American College of Medical Genetics and Genomicsによると、45–54回のリピートはグレーゾーンまたはボーダーラインと見なされており、55–200回のリピートは前変異(premutation)、200回以上のリピートはFMR1遺伝子の全変異(full mutation)であると見なされる[23]。全変異型FMR1遺伝子の完全なDNA配列は2012年に1分子リアルタイムシーケンシングを用いて初めて報告された[24]。これはトリプレットリピート病の1例である。トリヌクレオチドリピートの伸長は、DNA修復またはDNA複製時のDNA鎖の滑りによって生じている可能性が高い[25]

FMRPはクロマチン結合タンパク質であり、DNA損傷応答過程に機能する[26][27]。FMRPは減数分裂染色体上に存在し、精子形成過程でのDNA損傷応答装置のダイナミクスを調節する[26]

関連する疾患

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脆弱X症候群

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脆弱X症候群のほぼ全ての症例は、FMR1遺伝子のトリヌクレオチドリピートの伸長によって引き起こされている。こうした症例では、200回から1000回以上に及ぶCGGの異常な反復がみられる。その結果、FMR1遺伝子のこの部分はメチル化され、転写サイレンシングされる(遺伝子がオフとなり、タンパク質が産生されなくなる)[28]。FMRPが適切なレベルで存在しない場合、脆弱X症候群でみられる身体的異常とともに、重度の学習障害や知的障害が生じる場合がある。

脆弱X症候群の全症例のうち、FMR1遺伝子の一部または全部の欠失、もしくは塩基対の変化によるアミノ酸の変化によって引き起こされているものは1%未満である[28]。こうした変異はFMRPタンパク質の三次元構造を破壊するか、タンパク質の合成を防ぐことで、脆弱X症候群の症状を引き起こしている。

FMR1遺伝子のCGG配列のリピートが55–200回の場合、前変異として記載される。前変異を抱える人々の一部は、不安障害抑うつなどの健康問題を抱える可能性がある[29]

脆弱X随伴振戦/失調症候群

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FMR1遺伝子の前変異は脆弱X随伴振戦/失調症候群英語版(FXTAS)のリスクの増加と関係している[30]。FXTASは失調振戦健忘、下肢の感覚の喪失(ニューロパチー)、精神状態や行動の変化によって特徴づけられる。通常、この疾患は高齢になってから発症する。

早発卵巣不全

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FMR1遺伝子は、認知・神経機能とは独立して、卵巣の機能にも非常に重要な役割を果たしている。脆弱X症候群を引き起こさないような、わずかなCGGリピートの伸長も、女性が早期に卵巣機能を失う早発卵巣不全(潜在性の原発性卵巣機能不全)のリスクの増加と関係している[31][32][33]

多嚢胞性卵巣症候群

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FMR1遺伝子のきわめて特殊な遺伝子型多嚢胞性卵巣症候群(PCOS)と関係している。heterozygous-normal/low型と呼ばれる遺伝子型によって、若年時に過剰な卵胞の活動や過剰に活発な卵巣機能といった多嚢胞性表現型が引き起こされる[34]

相互作用

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FMRPは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000102081 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000838 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Identification of a gene (FMR-1) containing a CGG repeat coincident with a breakpoint cluster region exhibiting length variation in fragile X syndrome”. Cell 65 (5): 905–14. (May 1991). doi:10.1016/0092-8674(91)90397-H. PMID 1710175. 
  6. ^ “Characterization and localization of the FMR-1 gene product associated with fragile X syndrome”. Nature 363 (6431): 722–4. (June 1993). doi:10.1038/363722a0. hdl:1765/56659. PMID 8515814. http://repub.eur.nl/pub/56659. 
  7. ^ "Fragile X Mental Retardation" The Human Gene Compendium
  8. ^ “FMR1 Premutation: Basic Mechanisms and Clinical Involvement”. Cerebellum 15 (5): 543–5. (October 2016). doi:10.1007/s12311-016-0808-7. PMID 27338822. 
  9. ^ a b “Localization of FMRP-associated mRNA granules and requirement of microtubules for activity-dependent trafficking in hippocampal neurons”. Genes, Brain, and Behavior 4 (6): 350–9. (August 2005). doi:10.1111/j.1601-183X.2005.00128.x. PMID 16098134. 
  10. ^ “Altered synaptic plasticity in a mouse model of fragile X mental retardation”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 (11): 7746–50. (May 2002). doi:10.1073/pnas.122205699. PMC 124340. PMID 12032354. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC124340/. 
  11. ^ “Metabotropic glutamate receptors trigger postsynaptic protein synthesis”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 90 (15): 7168–71. (August 1993). doi:10.1073/pnas.90.15.7168. PMC 47097. PMID 8102206. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC47097/. 
  12. ^ “Dendritic spines elongate after stimulation of group 1 metabotropic glutamate receptors in cultured hippocampal neurons”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 99 (3): 1639–44. (February 2002). doi:10.1073/pnas.032681099. PMC 122243. PMID 11818568. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC122243/. 
  13. ^ a b “Fragile X mental retardation protein is translated near synapses in response to neurotransmitter activation”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 94 (10): 5395–400. (May 1997). doi:10.1073/pnas.94.10.5395. PMC 24689. PMID 9144248. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC24689/. 
  14. ^ “Local functions for FMRP in axon growth cone motility and activity-dependent regulation of filopodia and spine synapses”. Molecular and Cellular Neurosciences 32 (1–2): 37–48. (2006). doi:10.1016/j.mcn.2006.02.001. PMID 16631377. 
  15. ^ “Purified recombinant Fmrp exhibits selective RNA binding as an intrinsic property of the fragile X mental retardation protein”. The Journal of Biological Chemistry 273 (25): 15521–7. (June 1998). doi:10.1074/jbc.273.25.15521. PMID 9624140. 
  16. ^ “Essential role for KH domains in RNA binding: impaired RNA binding by a mutation in the KH domain of FMR1 that causes fragile X syndrome”. Cell 77 (1): 33–9. (April 1994). doi:10.1016/0092-8674(94)90232-1. PMID 8156595. 
  17. ^ “Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation”. Human Molecular Genetics 10 (4): 329–38. (February 2001). doi:10.1093/hmg/10.4.329. PMID 11157796. 
  18. ^ a b “Dynamic translational and proteasomal regulation of fragile X mental retardation protein controls mGluR-dependent long-term depression”. Neuron 51 (4): 441–54. (August 2006). doi:10.1016/j.neuron.2006.07.005. PMID 16908410. 
  19. ^ a b “The fragile X syndrome protein represses activity-dependent translation through CYFIP1, a new 4E-BP”. Cell 134 (6): 1042–54. (September 2008). doi:10.1016/j.cell.2008.07.031. PMID 18805096. 
  20. ^ “Dysregulated metabotropic glutamate receptor-dependent translation of AMPA receptor and postsynaptic density-95 mRNAs at synapses in a mouse model of fragile X syndrome”. The Journal of Neuroscience 27 (20): 5338–48. (May 2007). doi:10.1523/JNEUROSCI.0937-07.2007. PMID 17507556. 
  21. ^ “The fragile X syndrome protein FMRP associates with BC1 RNA and regulates the translation of specific mRNAs at synapses”. Cell 112 (3): 317–27. (February 2003). doi:10.1016/S0092-8674(03)00079-5. PMID 12581522. 
  22. ^ “Fragile X protein controls the efficacy of mRNA transport in Drosophila neurons”. Molecular and Cellular Neurosciences 39 (2): 170–9. (October 2008). doi:10.1016/j.mcn.2008.06.012. PMID 18655836. 
  23. ^ Technical Standards and Guidelines for Fragile X”. American College of Medical Genetics (2000年10月2日). 2013年3月29日閲覧。
  24. ^ “Sequencing the unsequenceable: expanded CGG-repeat alleles of the fragile X gene”. Genome Research 23 (1): 121–8. (January 2013). doi:10.1101/gr.141705.112. PMC 3530672. PMID 23064752. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3530672/. 
  25. ^ “Repeat instability during DNA repair: Insights from model systems”. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 50 (2): 142–67. (2015). doi:10.3109/10409238.2014.999192. PMC 4454471. PMID 25608779. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4454471/. 
  26. ^ a b “A chromatin-dependent role of the fragile X mental retardation protein FMRP in the DNA damage response”. Cell 157 (4): 869–81. (May 2014). doi:10.1016/j.cell.2014.03.040. PMC 4038154. PMID 24813610. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4038154/. 
  27. ^ “The Fragile X Protein and Genome Function”. Mol. Neurobiol. 56 (1): 711–721. (May 2018). doi:10.1007/s12035-018-1122-9. PMID 29796988. 
  28. ^ a b Garber, Kathryn B.; Visootsak, Jeannie; Warren, Stephen T. (2008-06). “Fragile X syndrome”. European journal of human genetics: EJHG 16 (6): 666–672. doi:10.1038/ejhg.2008.61. ISSN 1018-4813. PMC 4369150. PMID 18398441. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18398441. 
  29. ^ Bailey, Donald B.; Raspa, Melissa; Olmsted, Murrey; Holiday, David B. (2008-08-15). “Co-occurring conditions associated with FMR1 gene variations: findings from a national parent survey”. American Journal of Medical Genetics. Part A 146A (16): 2060–2069. doi:10.1002/ajmg.a.32439. ISSN 1552-4833. PMID 18570292. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18570292. 
  30. ^ Hagerman, Randi; Hagerman, Paul (2013-08). “Advances in clinical and molecular understanding of the FMR1 premutation and fragile X-associated tremor/ataxia syndrome”. The Lancet. Neurology 12 (8): 786–798. doi:10.1016/S1474-4422(13)70125-X. ISSN 1474-4465. PMC 3922535. PMID 23867198. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23867198. 
  31. ^ “The FMR1 gene as regulator of ovarian recruitment and ovarian reserve”. Obstetrical & Gynecological Survey 65 (8): 523–30. (August 2010). doi:10.1097/OGX.0b013e3181f8bdda. PMID 20955631. 
  32. ^ “CGG repeat sizing in the FMR1 gene in Indian women with premature ovarian failure”. Reproductive Biomedicine Online 19 (2): 281–6. (August 2009). doi:10.1016/s1472-6483(10)60086-7. PMID 19712568. 
  33. ^ “Intermediate and premutation FMR1 alleles in women with occult primary ovarian insufficiency”. Fertility and Sterility 92 (2): 464–70. (August 2009). doi:10.1016/j.fertnstert.2008.07.007. PMID 18973899. 
  34. ^ Gleicher, Norbert; Weghofer, Andrea; Lee, Irene H.; Barad, David H. (2010-12-16). “FMR1 genotype with autoimmunity-associated polycystic ovary-like phenotype and decreased pregnancy chance”. PloS One 5 (12): e15303. doi:10.1371/journal.pone.0015303. ISSN 1932-6203. PMC 3002956. PMID 21179569. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21179569. 
  35. ^ a b “A highly conserved protein family interacting with the fragile X mental retardation protein (FMRP) and displaying selective interactions with FMRP-related proteins FXR1P and FXR2P”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 98 (15): 8844–9. (July 2001). doi:10.1073/pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC37523/. 
  36. ^ a b c “82-FIP, a novel FMRP (fragile X mental retardation protein) interacting protein, shows a cell cycle-dependent intracellular localization”. Human Molecular Genetics 12 (14): 1689–98. (July 2003). doi:10.1093/hmg/ddg181. PMID 12837692. 
  37. ^ a b “Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them”. Molecular and Cellular Biology 16 (7): 3825–32. (July 1996). doi:10.1128/mcb.16.7.3825. PMC 231379. PMID 8668200. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC231379/. 
  38. ^ a b “The fragile X mental retardation syndrome protein interacts with novel homologs FXR1 and FXR2”. The EMBO Journal 14 (21): 5358–66. (November 1995). doi:10.1002/j.1460-2075.1995.tb00220.x. PMC 394645. PMID 7489725. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC394645/. 
  39. ^ “Isolation of an FMRP-associated messenger ribonucleoprotein particle and identification of nucleolin and the fragile X-related proteins as components of the complex”. Molecular and Cellular Biology 19 (12): 7925–32. (December 1999). doi:10.1128/mcb.19.12.7925. PMC 84877. PMID 10567518. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC84877/. 
  40. ^ “A novel RNA-binding nuclear protein that interacts with the fragile X mental retardation (FMR1) protein”. Human Molecular Genetics 8 (13): 2557–66. (December 1999). doi:10.1093/hmg/8.13.2557. PMID 10556305. 

関連文献

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外部リンク

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