山本 孝二(やまもと こうじ、1941年3月30日 - )は、日本の国土交通技官。気象庁長官を務めた。
北海道出身[1]。1963年に北海道大学理学部を卒業し、同年に気象庁に入庁[1]。1995年に仙台管区気象台長、1996年4月に地震火山部長、1998年4月に予報部長を経て、2000年4月から2003年3月までに長官を務めた[1][2]。