La stagione maschile ebbe inizio il 27 novembre 1999 e si concluse il 19 marzo 2000. Furono disputate 21 gare individuali (6 a tecnica classica, 7 a tecnica libera, 6 sprint, 2 inseguimento) e 6 a squadre (5 staffette, 1 sprint a squadre), in 18 diverse località. Lo spagnoloJohann Mühlegg si aggiudicò sia la coppa di cristallo, il trofeo assegnato al vincitore della classifica generale, sia Coppa di lunga distanza; il finlandeseJari Isometsä vinse la Coppa di media distanza, il norvegeseMorten Brørsquella di sprint. Bjørn Dæhlie era il detentore uscente della Coppa generale.
La stagione femminile ebbe inizio il 27 novembre 1999 e si concluse il 18 marzo 2000. Furono disputate 21 gare individuali (5 a tecnica classica, 8 a tecnica libera, 6 sprint, 2 inseguimento) e 6 a squadre (5 staffette, 1 sprint a squadre), in 18 diverse località. La norvegese Bente Skari si aggiudicò sia la coppa di cristallo, sia la Coppa di sprint; la russaLarisa Lazutina vinse la Coppa di lunga distanza, l'estoneKristina Šmigun-Vähi quella di media distanza. La Skari era la detentrice uscente della Coppa generale.
Venne anche disputata anche una gara a squadre mista (staffetta 2x5 km 2x10 km) e per la prima fu inserita nel calendario di Coppa una classica del granfondo: la Transjurassienne.