Nella stagione 2009-2010 il Pavia disputa il girone A del campionato di Lega Pro di Seconda Divisione, con 57 punti ha ottenuto il quinto posto, con il diritto acquisito a partecipare ai Play-off. Nelle semifinali dei Play-off è stato superato dallo Spezia. Sono saliti in Prima Divisione il Sudtirol diretto e lo Spezia che vince i Play-off. A pavia il rimpasto societario tra la famiglia Calisti e la famiglia Zanchi, ha portato finalmente ad un campionato di vertice. Allenata dal confermato Amedeo Mangone la squadra pavese raccoglie 27 punti nel girone di andata e 30 nel girone di ritorno, centrando l'obiettivo di partecipare ai Play-off. In evidenza tre marcatori, Benny Carbone chiude la carriera a 39 anni con una stupenda stagione, realizzando 16 reti, 3 in Coppa Italia e 13 in campionato, ben spalleggiato da Andrea Ferretti, che ne realizza 11 e Leonardo Pavoletti che ne firma 9. Nella Coppa Italia di Lega Pro il Pavia disputa il girone B di qualificazione, che ha promosso il Rodengo Saiano.
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