Skip to content

seevdey/Needleman-Wunsch-Algorithm

Repository files navigation

Needleman-Wunsch-Algorithm

Bu projede dışarıdan alınan iki DNA dizisinin Needleman-Wunsch hizalama algoritması kullanarak sıralama işlemini gerçekleştiren görsel bir uygulama yapılacaktır. Gerçekleştireceğiniz algoritmada aşağıdaki adımlar göz önünde bulundurulacaktır.

  1. Match, Mismatch ve Gap değerleri dışarıdan girilecektir. Program başlangıcında default değerler 1,-1,-2 olmalıdır.
  2. Algoritmanız seq1.txt ve seq2.txt adında iki metin dosyasını girdi olarak almalıdır. Her .txt dosyası iki satırdan oluşmalıdır. İlk satır, dizinin uzunluğunu belirten bir l tamsayısına, ikinci satır ise {A, C, G, T} kümesinden oluşan semboller kullanarak l uzunluğundaki karakter dizisi bulunmalıdır.
  3. Algoritmanız, verilen iki dizinin optimal global hizalamasını ve puanı vermelidir.
  4. Algoritmanızın çalışma süresini verin.
  5. Programınız görsel olarak dinamik bir tablo sunmalıdır

About

No description, website, or topics provided.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages