En general, material deprecado será el que no es alcanzable desde la página
principal, porque ya no se usa en clase para alcanzar los objetivos de
aprendizaje.

Para eliminar cualquier material deprecado, habría que borrar los ficheros en
sí, borrar las referencias a los mismos si las hubiera (no en el material
principal, claro) y borrar también el directorio si se han borrado todos los
ficheros en el mismo (lo que GitHub hace automáticamente, pero si hay un dotfile
o un README sólo, también se puede borrar).

Así, al pronto, se me ocurren

• Exámenes
• Tutorial de Ruby

En caso de duda, se puede preguntar aquí en el issue antes de crear un PR.