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Genevestigator

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Genevestigator est une base de données de résultats d'analyses de transcriptomes couplée à un outil de méta-analyse accessible en ligne[1]. La base de données contenait début 2009 les données de 20872 expériences de transcriptomes pour 6 organismes modèles différents: humain[2], souris, rat, Arabidopsis thaliana[3], orge, riz et soja.

Notes et références

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  1. Aleel K Grennan, « Genevestigator. Facilitating web-based gene-expression analysis », Plant Physiology, vol. 141, no 4,‎ , p. 1164-6 (ISSN 0032-0889, DOI 10.1104/pp.104.900198, lire en ligne, consulté le )
  2. Oliver Laule, « Web-based analysis of the mouse transcriptome using Genevestigator », BMC Bioinformatics, vol. 7,‎ , p. 311 (ISSN 1471-2105, DOI 10.1186/1471-2105-7-311, lire en ligne, consulté le )
  3. Philip Zimmermann, « GENEVESTIGATOR. Arabidopsis microarray database and analysis toolbox », Plant Physiology, vol. 136, no 1,‎ , p. 2621-32 (ISSN 0032-0889, DOI 10.1104/pp.104.046367, lire en ligne, consulté le )

Articles connexes

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Liens externes

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Bibliographie

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  • (en) T Hruz, O Laule, G Szabo, F Wessendorp, S Bleuler, L Oertle, P Widmayer, W Gruissem et P Zimmermann, « Genevestigator V3: a reference expression database for the meta-analysis of transcriptomes », Advances in Bioinformatics, vol. 2008,‎ (DOI 10.1155/2008/420747, lire en ligne)