ULEB Eurocup 2008–09 oli seitsemäs kausi, joka järjestettiin nimellä ULEB Eurocup. Joukkueita oli 48 ja 22 maata. Edelliskauteen verrattuna joukkueiden määrää siis pudotettiin kuudella. Sarjassa pelasi myös kaksi suomalaista, Teemu Rannikko, jonka joukkueena oli Khimki BC sekä Shawn Huff, joka pelasi Maroussissa. Kauden voitti liettualainenBC Lietuvos Rytas.
16 joukkuetta pelasivat kaksiosaiset ottelut, joiden voittaja pääsi seuraavalle kierrokselle. Joukkue, jolla oli enemmän yhteispisteitä tehtynä pääsi jatkoon. Parien häviäjät joutuivat pelaamaan EuroChallengeen. Vielä tässä vaiheessa FIBA Europe oli sarjan särjestäjä. Ottelut pelattiin 14. lokakuuta – 21. lokakuuta.
Italian koripalloliitto ei antanut Orlandina Basketille liigalisenssiä, jonka takia Benetton Treviso pääsi suoraan lohkovaiheeseen. Myös Fribourg Olympic pääsi suoraan jatkoon, mutta se joutui menemään toiselle karsintakierrokselle.
Mukana oli 16 joukkuetta: kahdeksan ensimmäiseltä karsintakierrokselta mukaan päässyttä, sekä kahdeksan automaattisesti valittua joukkuetta. Samalla tapaa olivat ottelut nytkin kaksiosaisia ja enemmän pisteitä tehnyt joukkue pääsi jatkoon. Kahdeksan jatkoonmennyttä joukkuetta osallistuivat Eurocupin runkosarjaan ja hävinneet joutuivat EuroChallengeen. Ottelut pelattiin 4. marraskuuta – 11. marraskuuta.
Mukana oli yhteensä 32 joukkuetta; 24 automaattisesti päässyttä joukkuetta, sekä kahdeksan karsintojen kautta päässyttä. Tästä lähtien sarjaa ylläpiti ULEB. Joukkueet jaettiin neljän joukkueen lohkoihin, jolloin lohkoja oli yhteensä kahdeksan. Joukkueet pelasivat kahdesti toisiaan vastaan ja lohkojen kaksi parasta pääsivät jatkoon. Pelit pelattiin 25. marraskuuta – 13. tammikuuta.
Ensimmäistä kertaa historiassa pelattiin 16:n parhaan joukkueen kesken karsinta. Joukkueet jaettiin neljään neljän joukkueen lohkoon, joiden kaksi parasta pääsivät seuraavaan vaiheeseen. Pelit pelattiin 27. tammikuuta – 10. maaliskuuta.
Lohkohen ykköset pelasivat toisen lohkon kakkoseksi tullutta vastaan pelin. Pelin voittaja eteni semifinaaliin, jossa se pelasi uuden pelin, jonka voittaja pääsi loppuotteluun. Turnaus pelattiin Torinossa9. huhtikuuta – 12. huhtikuuta.