John Jumper
John Michael Jumper (s. 1985 Little Rock, Arkansas, Yhdysvallat) on yhdysvaltalainen kemisti ja tietojenkäsittelytieteilijä, joka on ollut vuodesta 2018 mukana DeepMindilla AlphaFold-projektin vanhempana tutkijana. Hänen johtama ryhmänsä onnistui kehittämään AlphaFoldista version, joka pystyy tekoälyä hyödyntäen ennustamaan oikein proteiinin rakenteen. Jumper ja DeepMindin toimitusjohtaja Demis Hassabis saivat 2024 työstään Nobelin kemianpalkinnon.
| John Jumper | |
|---|---|
 |
|
| Henkilötiedot | |
| Syntynyt | 1985 (ikä 38–39) Little Rock, Arkansas, Yhdysvallat |
| Koulutus ja ura | |
| Tutkinnot |
Vanderbiltin yliopisto Chicagon yliopisto |
| Väitöstyön ohjaaja | Tobin R. Sosnick (käännä suomeksi) ja Karl Freed |
| Instituutti | DeepMind |
| Tutkimusalue | tietojenkäsittelytiede |
| Tunnetut työt | AlphaFold |
| Palkinnot |
Albert Lasker -palkinto lääketieteellisestä perustutkimustyöstä (2023) Nobelin kemianpalkinto (2024) |
Elämäkerta
muokkaaJumper syntyi Little Rockissa 1985 ja suoritti 2007 Vanderbiltin yliopistossa alemman korkeakoulututkinnon fysiikasta ja matematiikasta. Hän jatkoi Cambridgen yliopiston tohtoriohjelmaan alanaan tiiviin aineen fysiikka. Hän ei kuitenkaan pitänyt alaa omanaan ja siirtyi työskentelemään D. E. Shaw Researchiin proteiinien tietokonesimulaatioiden parissa.[1][2]
Jumper palasi 2011 väitöstutkimuksen pariin, tällä kertaa Chicagon yliopistossa teoreettisen kemian ohjelmassa. Väitöstyössään hän käytti koneoppimista proteiinien dynamiikan tutkimisessa.[1] Jumper valmistui tohtoriksi 2017.[2]
Jumper aloitti 2018 DeepMindin vanhempana tutkijana.[2] Hän pääsi mukaan AlphaFold-projektiin ja esitti pian uusia ideoita AlphaFold2:ta varten. DeepMindin toimitusjohtaja Demis Hassabis vakuuttui Jumperin ajatuksista ja teki hänestä AlphaFold2-projektin johtajan. Hassabis uskoi, että Jumperin monialainen tausta proteiinifysiikasta ja koneoppimisesta auttaisi ohjelman kehittämisessä.[3]
Jumperin ja Hassabisin johdolla AlphaFold suunniteltiin kokonaan uudestaan, ja he osallistuivat kakkosversiolla vuonna 2020 proteiinien rakennetta ennustavaan CASP-kilpailuun. AlphaFold2 voitti ylivoimaisesti kaikki kilpailijat ja pystyi ennustamaan proteiinirakenteen atomin tarkkuudella.[3]
Jumperin johtama ryhmä paljasti toukokuussa 2024 AlphaFoldin kolmannen version, joka pystyi proteiinien lisäksi ennustamaan myös DNA- ja RNA-rakenteita.[4]
Tunnustukset
muokkaaJumper on saanut urallaan useita tunnustuksia proteiinirakenteen kolmiulotteisen rakenteen ennustamiseen kehitetyn teknologian keksimisessä. Hän jakoi 2023 Hassabisin kanssa Albert Lasker -palkinnon lääketieteellisestä perustutkimustyöstä.[5] Vuonna 2024 hän sai Hassabisin kanssa puolet Nobelin kemianpalkinnosta. Toinen puoli myönnettiin David Bakerille.[6]
Lähteet
muokkaa- ↑ a b John Michael Jumper Fundación BBVA. Viitattu 9.10.2024. (englanniksi)
- ↑ a b c Dr. John Jumper VinFuture Prize. Viitattu 9.10.2024. (englanniksi)
- ↑ a b James E. Rothman: Starting at Go: Protein structure prediction succumbs to machine learning. PNAS, 26.9.2023, 120. vsk, nro 39. National Academy of Sciences. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 9.10.2024. (englanniksi)
- ↑ Harry Booth: John Jumper Time. 5.9.2024. Time USA, LLC. Viitattu 9.10.2024. (englanniksi)
- ↑ AlphaFold—for predicting protein structures Albert and Mary Lasker Foundation. Viitattu 9.10.2024. (englanniksi)
- ↑ Heikki Ali-Hokka: Kemian Nobel proteiinien tutkijoille – ”Uudet proteiinit tekevät maailmasta paremman paikan” Yle Uutiset. 9.10.2024. Yleisradio. Viitattu 9.10.2024.