Pharmakophor

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Beispiel eines Pharmakophormodells.

Ein Pharmakophor ist derjenige Teil (bzw. besteht aus denjenigen Eigenschaften) eines Moleküls, die für dessen pharmakologische Wirkung verantwortlich sind. Dabei werden alle sterischen und elektronischen Eigenschaften, die notwendig sind, um Wechselwirkungen mit einer bestimmten biologischen Zielstruktur (Target) zu ermöglichen und eine biologische Antwort auszulösen oder zu blockieren, berücksichtigt[1].

In der modernen Computerchemie spielen Pharmakophore eine wichtige Rolle. Mit der Hilfe Quantitativer Struktur-Wirkungs-Beziehungen ist es möglich, aus der Struktur von Arzneistoffen und ihren pharmakologischen Eigenschaften Pharmakophore abzuleiten. Andererseits können anhand bekannter Pharmakophore Datenbanken auf potenziell wirksame Arzneistoffe durchsucht werden.

Der Begriff Pharmakophor wird historisch oft Paul Ehrlich zugeschrieben, ohne dass er ihn je nachweislich verwendete.[2] In seinem 1909 erschienenen Beitrag „Über den jetzigen Stand der Chemotherapie“[3] beschrieb er, wie bereits einige Jahre zuvor John Newport Langley, einige vage Merkmale eines Pharmakophors, die für eine Ligand-Rezeptor-Wechselwirkung verantwortlich sind. Das eigentliche Konzept des Pharmakophors wurde erstmals 1967 von Lemont B. Kier formuliert[4] und 1971 das erste Mal als Begriff verwendet.[5]

  • ChEMBL, Datenbank bioaktiver Verbindungen, European Bioinformatics Institute
  1. IUPAC Definition
  2. J.H. van Drie: Monty Kier and the Origin of the Pharmacophore Concept. In: Internet Electronic Journal of Molecular Design. Band 6, 2007, S. 271–279 (online [PDF]).
  3. P. Ehrlich: Über den jetzigen Stand der Chemotherapie. In: Berichte der deutschen chemischen Gesellschaft. Band 42, Nr. 1, Januar 1909, S. 17–47, doi:10.1002/cber.19090420105.
  4. L.B. Kier: Molecular Orbital Calculation of Preferred Conformations of Acetylcholine, Muscarine, and Muscarone. In: Molecular Pharmacology. Band 3, 1967, S. 487–494 (aspetjournals.org).
  5. L. B. Kier: MO Theory in Drug Research. Academic Press, New York 1971, ISBN 978-0-12-406550-5, S. 164–169.