Desulfovibrio

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Desulfovibrio

TEM-Aufnahmen von „Ca. D. trichonymphae“ Rs-N31, einem Ektosymbionten von Trichonympha collaris (Parabasalia) im Verdauungstrakt der Termite Zootermopsis nevadensis.

Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Pseudomonadota
Klasse: Deltaproteobacteria
Ordnung: Desulfovibrionales
Familie: Desulfovibrionaceae
Gattung: Desulfovibrio
Wissenschaftlicher Name
Desulfovibrio
(Beijerinck 1895) Kluyver & van Niel 1936
Das Bild skizziert die Korrosion unter anaeroben Bedingungen, die durch bestimmte Bakterien wie z. B. Desulfovibrio-Arten verursacht wird.

Desulfovibrio ist eine Gattung Gram-negativer Sulfat-redu­zierender Bakterien. Desulfovibrio-Arten sind häufig in Gewässern mit hohem Anteil an organischem Material sowie in wassergesättigten Böden anzutreffen. Sie sind wichtige Mitglieder von Gemeinschaften in extrem oligotrophen Lebensräumen, wie z. B. in zerklüfteten tiefen granitischen Grundwasserleitern. In der Pathologie wurden hohe Mengen an Desulfo­vibrio-Bakterien mit (chronisch-)entzündlichen Darmerkrankungen, Bakteriämien (bakteriellen Infektionen) und der Parkinson-Krankheit in Verbindung gebracht.[1][2]

Von einige Desulfovibrio-Arten ab ca. 1992 gezeigt, dass sie ein Potential für die Bioremediation toxischer Radionuklide wie Uran haben. Dies wird ermöglicht durch einen reduktiven Bioakkumulationsprozess, d. h. durch die biologische Umwandlung (Präzipitation oder Ausfällung) von gut wasserlöslichem Uran(VI) in relativ unlösliches Uran(IV), worauf das toxische Uran aus dem kontaminierten Wasser entfernt werden kann.[3]

Systematik

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Die gegenwärtig akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[4] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI).[5]

Synonyme

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Die LPSN betrachtet die folgenden Gattungsnamen als Synonyme von Desulfovibrio:

  • Desulfomonas Moore et al. 1976 alias Moore, Johnson & Holdeman 1976
  • „Aminidesulfovibrio“ Waite et al. 2020
  • „Psychrodesulfovibrio“ Galushko & Kuever 2020
  • „Alteridesulfovibrio“ Galushko & Kuever 2019
  • „Frigididesulfovibrio“ Waite et al. 2020
  • „Alteridesulfovibrio“ Waite et al. 2020
  • „Frigididesulfovibrio“ Galushko & Kuever 2019
  • „Aminidesulfovibrio“ Galushko & Kuever 2019

Artenliste

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TEM-Aufnahmen von „Ca. D. kirbyi“ ZnDsv-02, einem weiteren Ekto­sym­bionten von T. collaris im Verdau­ungs­trakt der Termite Z. nevadensis.

Artenliste nach der LPSN (Stand 17. Dezember 2023):[4]

  • Desulfovibrio aminophilus Baenaet al. 1999
  • „Desulfovibrio biadhensis“ Fadhlaoui et al. 2015
  • „Desulfovibrio caledoniensis“ Wu et al. 2002
  • „Desulfovibrio cavernae“ Sa​ss & Cypionka 2004
  • Desulfovibrio cuneatus Sa​ss et al. 1998
  • Desulfovibrio desulfuricans (Beijerinck 1895) Kluyver & van Niel 1936
  • „Desulfovibrio diazotrophicus“ corrig. Sayavedra et al. 2021
  • „Candidatus Desulfovibrio faecigallinarum“ Gilroy et al. 2021
  • „Desulfovibrio fairfieldensis“ McDougall et al. 1997
  • „Desulfovibrio ferrophilus“ Emerson et al. 2007
  • Desulfovibrio furfuralis Folkerts et al. 1989
  • „Candidatus Desulfovibrio gallistercoris“ Gilroy et al. 2021
  • Desulfovibrio giganteus corrig. Esnault et al. 1988
  • Desulfovibrio gilichinskyi Ryzhmanova et al. 2019
  • „Desulfovibrio hontreensis“ Tarasov et al. 2015
  • Desulfovibrio indonesiensis corrig. Feio et al. 2000
  • Desulfovibrio inopinatus Reichenbecher & Schink 1999
  • Desulfovibrio intestinalis Fröhlich et al. 1999
  • „Candidatus Desulfovibrio intestinavium“ Gilroy et al. 2021
  • „Candidatus Desulfovibrio intestinigallinarum“ Gilroy et al. 2021
  • „Candidatus Desulfovibrio intestinipullorum“ Gilroy et al. 2021
  • „Candidatus Desulfovibrio kirbyi“ Takeuchi et al. 2020
  • Desulfovibrio legallii corrig. Thabet et al. 2013
  • Desulfovibrio litoralis Sa​ss et al. 1998
  • Desulfovibrio longreachensis corrig. Redburn & Patel 1995
  • „Desulfovibrio mangrovi“ Zhou et al. 2023
  • „Desulfovibrio multispirans“ Czechowski et al. 1984
  • „Desulfovibrio oryzae“ Bacmaga et al. 2020
  • Desulfovibrio oxyclinae Krekeler et al. 2000
  • Desulfovibrio piger (Moore et al. 1976) Loubinoux et al. 2002
  • Desulfovibrio porci Wylensek et al. 2021
  • Desulfovibrio psychrotolerans Sasi Jyothsna et al. 2008
  • Desulfovibrio simplex Zellner et al. 1990
  • „Desulfovibrio singaporenus“ Sheng et al. 2008
  • Desulfovibrio subterraneus Ueno et al. 2021
  • „Candidatus Desulfovibrio trichonymphae“ Sato et al. 2009
  • Desulfovibrio zosterae Nielsen et al. 1999

Verschiebungen

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Die folgenden Arten sind nach der LPSN nicht (mehr) Mitglieder der Gattung Desulfovibrio, sondern anderen (neuen) Gattungen innerhalb der Familie Desulfovibrionaceae zugeordnet:[4]

  • Desulfovibrio vulgaris → Nitratidesulfovibrio vulgaris (Postgate & Campbell 1966) Waite et al. 2020
  • Desulfovibrio alaskensis → Oleidesulfovibrio alaskensis (Feio et al. 2004) Waite et al. 2020
  • Desulfovibrio lacusfryxellense → Maridesulfovibrio lacusfryxellense (Sattley & Madigan 2010) Galushko & Kuever 2021
  • …

Zur Familie Pseudomonadaceae (Gammaproteobacteria) wird in der LPSN zugeordnet:[4]

  • Desulfovibrio desulfuricans, ursprünglich Vibrio desulfuricans (NCBI) -> Sporovibrio Starkey 1938

Phylogenie

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Zur Phylogenie der Gattung Desulfovibrio wurden u. a. folgende Vorschläge gemacht:

16S-rRNA-basiert LTP_01_2022[6] Auf 120 Markerproteinen basierend GTDB 07-RS207[7]


D. piger


   


D. legallii


   

D. porci



   

D. desulfuricans


   

D. intestinalis


   

D. simplex Zellner et al. 1990






Vorlage:Klade/Wartung/Style



"Ca. D. faecigallinarum" Gilroy et al. 2021


   

"Ca. D. intestinipullorum" Gilroy et al. 2021



   


D. piger (Moore et al. 1976) Loubinoux et al. 2002


   

"Ca. D. intestinigallinarum" Gilroy et al. 2021


   

"Ca. D. gallistercoris" Gilroy et al. 2021


   

"Ca. D. intestinavium" Gilroy et al. 2021





   



"D. fairfieldensis" McDougall et al. 1997


   

D. porci Wylensek et al. 2021



   

"Ca. D. kirbyi" Takeuchi et al. 2020


   

"Ca. D. trichonymphae" Sato et al. 2009




   

D. legallii corrig. Thabet et al. 2013


   

D. desulfuricans (Beijerinck 1895) Kluyver & van Niel 1936


   

D. intestinalis Frohlich et al. 1999







Vorlage:Klade/Wartung/Style
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  • Amira Amrani, Aurelie Bergon, Helene Holota, Christian Tamburini, Marc Garel, Bernard Ollivier, Jean Imbert, Alain Dolla: Transcriptomics Reveal Several Gene Expression Patterns in the Piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in Response to Hydrostatic Pressure. In: PLOS ONE. 9. Jahrgang, Nr. 9, 12. September 2014, S. e106831, doi:10.1371/journal.pone.0106831, PMID 25215865, PMC 4162548 (freier Volltext), bibcode:2014PLoSO...9j6831A (englisch).
  • H. Melvin Czechowski, H(arold). W. Rossmore: The Effect of Selected Industrial Biocides on Lactate Metabolism in Desulfovibrio desulfuricans. In: Developments in Industrial Microbiology, Kapitel 76, Society for Industrial Micobiology, 1981 (englisch).
  • Mohor Chatterjee, Yu Fan, Fang Cao, Aaron A. Jones, Giovanni Pilloni, Xiaozhou Zhang: Proteomic study of Desulfovibrio ferrophilus IS5 reveals overexpressed extracellular multi-heme cytochrome associated with severe microbiologically influenced corrosion. In: Nature: Scientific Reports, Band 11, 29. Juli 2021, S. 15458; doi:10.1038/s41598-021-95060-0, PMID 34326431, PMC 8322314 (freier Volltext) (englisch).

Literatur

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Einzelnachweise

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  1. ↑ Hong-Xia Fan, Shuo Sheng, Feng Zhang: New hope for Parkinson's disease treatment: Targeting gut microbiota. In: CNS Neuroscience & Therapeutics. 28. Jahrgang, Nr. 11, 13. Juli 2022, S. 1675–1688, doi:10.1111/cns.13916, PMID 35822696, PMC 9532916 (freier Volltext) – (englisch).
  2. ↑ Li, Zhe; Liang, Hongfeng; Hu, Yingyu: Gut bacterial profiles in Parkinson's disease: A systematic review. In: CNS Neuroscience & Therapeutics. 29. Jahrgang, Nr. 1, 25. Oktober 2023, S. 140–157, doi:10.1111/cns.13990, PMID 36284437, PMC 9804059 (freier Volltext) – (englisch).
  3. ↑ Derek R. Lovley, Elizabeth J. P. Phillips: Bioremediation of uranium contamination with enzymatic uranium reduction. In: Environmental Science & Technology. 26. Jahrgang, Nr. 11, November 1992, S. 2228​–2234, doi:10.1021/es00035a023, bibcode:1992EnST...26.2228L (englisch).
  4. ↑ a b c d LPSN: Genus Desulfovibrio Kluyver and van Niel 1936 (Approved Lists 1980).
  5. ↑ NCBI: Desulfovibrio, Details: [Desulfovibrio Kluyver and van Niel 1936 (Approved Lists 1980) emend. Loubinoux et al. 2002, …] (genus), heterotypic synonym: "Sporovibrio" Starkey 1938, Desulfomonas Moore et al. 1976.
  6. ↑ The LTP. Abgerufen am 23. Februar 2022 (englisch). Dazu:
    • LTP_all tree in newick format. Archiviert vom Original am 4. September 2022; abgerufen am 23. Februar 2022 (englisch).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/imedea.uib-csic.es
    • LTP_01_2022 Release Notes. Abgerufen am 23. Februar 2022 (englisch).
  7. ↑ GTDB: Desulfovibrionaceae (fam.). Mit: Dazu:
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