VAT1L
| VAT1L | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | VAT1L | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | MGI: 2142534 HomoloGene: 10855 GeneCards: VAT1L | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 16: 77.79 – 77.98 Mb | Chr 8: 114.93 – 115.1 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Homolog vezikulskog aminskog transportnog proteina 1, sličnog T. californica je protein koji je kod ljudi kodiran genom 0VAT1L.[5]
U ljudi gen VAT1L nalazi se na hromosomu 16, lokus q23.1. Prema podacima SAGE, ieksperimira se uglavnom u mozgu.[6]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 419 aminokiselina, a molekulska težina 45.899 Da.[7]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAKEGVEKAE | ETEQMIEKEA | GKEPAEGGGG | DGSHRLGDAQ | EMRAVVLAGF | ||||
| GGLNKLRLFR | KAMPEPQDGE | LKIRVKACGL | NFIDLMVRQG | NIDNPPKTPL | ||||
| VPGFECSGIV | EALGDSVKGY | EIGDRVMAFV | NYNAWAEVVC | TPVEFVYKIP | ||||
| DDMSFSEAAA | FPMNFVTAYV | MLFEVANLRE | GMSVLVHSAG | GGVGQAVAQL | ||||
| CSTVPNVTVF | GTASTFKHEA | IKDSVTHLFD | RNADYVQEVK | RISAEGVDIV | ||||
| LDCLCGDNTG | KGLSLLKPLG | TYILYGSSNM | VTGETKSFFS | FAKSWWQVEK | ||||
| VNPIKLYEEN | KVIAGFSLLN | LLFKQGRAGL | IRGVVEKLIG | LYNQKKIKPV | ||||
| VDSLWALEEV | KEAMQRIHDR | GNIGKLILDV | EKTPTPLMAN | DSTETSEAGE | ||||
| EEEDHEGDSE | NKERMPFIQ |
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000171724 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046844 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Vesicle amine transport protein 1 homolog (T. californica)-like". Pristupljeno 30. 6. 2013.
- ^ https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=VAT1L#expression
- ^ "UniProt, Q9HCJ6". Pristupljeno 11. 7. 2021.