Idi na sadržaj

SH3BP4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SH3BP4
Identifikatori
AliasiSH3BP4
Vanjski ID-jeviOMIM: 605611 MGI: 2138297 HomoloGene: 8726 GeneCards: SH3BP4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za SH3BP4
Genomska lokacija za SH3BP4
Bend2q37.2Početak234,952,017 bp[1]
Kraj235,055,714 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za SH3BP4
Genomska lokacija za SH3BP4
Bend1|1 DPočetak88,998,137 bp[2]
Kraj89,082,790 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
GDP-dissociation inhibitor activity
Ćelijska komponenta citoplazma
membrana
clathrin-coated pit
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
Egzosom
jedro
clathrin-coated vesicle
Biološki proces cellular response to amino acid stimulus
protein localization to lysosome
GO:0034259 negative regulation of GTPase activity
GO:0048552 regulation of catalytic activity
Endocitoza
negative regulation of cell growth
positive regulation of autophagy
amino acid import
negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of TOR signaling
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014521

NM_133816

RefSeq (bjelančevina)
NP_055336
NP_001358231
NP_001358232
NP_001358233
NP_001358234

NP_001358235

NP_598577

Lokacija (UCSC)Chr 2: 234.95 – 235.06 MbChr 1: 89 – 89.08 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein 4 sa vezanim domenom SH3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SH3BP4 sa hromosoma 2.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 963 aminokiseline, a molekulska težina 107.496 Da.[7]

1020304050
MAAQRIRAANSNGLPRCKSEGTLIDLSEGFSETSFNDIKVPSPSALLVDN
PTPFGNAKEVIAIKDYCPTNFTTLKFSKGDHLYVLDTSGGEWWYAHNTTE
MGYIPSSYVQPLNYRNSTLSDSGMIDNLPDSPDEVAKELELLGGWTDDKK
VPGRMYSNNPFWNGVQTNPFLNGNVPVMPSLDELNPKSTVDLLLFDAGTS
SFTESSSATTNSTGNIFDELPVTNGLHAEPPVRRDNPFFRSKRSYSLSEL
SVLQAKSDAPTSSSFFTGLKSPAPEQFQSREDFRTAWLNHRKLARSCHDL
DLLGQSPGWGQTQAVETNIVCKLDSSGGAVQLPDTSISIHVPEGHVAPGE
TQQISMKALLDPPLELNSDRSCSISPVLEVKLSNLEVKTSIILEMKVSAE
IKNDLFSKSTVGLQCLRSDSKEGPYVSVPLNCSCGDTVQAQLHNLEPCMY
VAVVAHGPSILYPSTVWDFINKKVTVGLYGPKHIHPSFKTVVTIFGHDCA
PKTLLVSEVTRQAPNPAPVALQLWGKHQFVLSRPQDLKVCMFSNMTNYEV
KASEQAKVVRGFQLKLGKVSRLIFPITSQNPNELSDFTLRVQVKDDQEAI
LTQFCVQTPQPPPKSAIKPSGQRRFLKKNEVGKIILSPFATTTKYPTFQD
RPVSSLKFGKLLKTVVRQNKNHYLLEYKKGDGIALLSEERVRLRGQLWTK
EWYIGYYQGRVGLVHTKNVLVVGRARPSLCSGPELSTSVLLEQILRPCKF
LTYIYASVRTLLMENISSWRSFADALGYVNLPLTFFCRAELDSEPERVAS
VLEKLKEDCNNTENKERKSFQKELVMALLKMDCQGLVVRLIQDFVLLTTA
VEVAQRWRELAEKLAKVSKQQMDAYESPHRDRNGVVDSEAMWKPAYDFLL
TWSHQIGDSYRDVIQELHLGLDKMKNPITKRWKHLTGTLILVNSLDVLRA
AAFSPADQDDFVI

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira protein sa 3 Asn-Pro-Phe (NPF) motiva, sa SH3 domenom, PXXP motivom, bipartitnim jedarnim ciljanim signalom i mjestom fosforilacije tirozina. Ovaj protein je uključen u kargo-specifičnu kontrolu endocitoza[ posredovanik klatrinom, posebno kontrolišući internalizaciju specifičnog proteinskog receptora.[6]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130147 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000036206 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Dunlevy JR, Berryhill BL, Vergnes JP, SundarRaj N, Hassell JR (Mar 2000). "Cloning, chromosomal localization, and characterization of cDNA from a novel gene, SH3BP4, expressed by human corneal fibroblasts". Genomics. 62 (3): 519–24. doi:10.1006/geno.1999.5994. PMID 10644451.
  6. ^ a b "Entrez Gene: SH3BP4 SH3-domain binding protein 4".
  7. ^ "UniProt, Q9P0V3" (jezik: engleski). Pristupljeno 19. 11. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]