Idi na sadržaj

RABIF

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
RABIF
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1FWQ, 2FU5

Identifikatori
AliasiRABIF
Vanjski ID-jeviOMIM: 603417 MGI: 2138605 HomoloGene: 37702 GeneCards: RABIF
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za RABIF
Genomska lokacija za RABIF
Bend1q32.1Početak202,878,282 bp[1]
Kraj202,889,149 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za RABIF
Genomska lokacija za RABIF
Bend1|1 E4Početak134,422,386 bp[2]
Kraj134,436,512 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona cinka
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona metala
guanyl-nucleotide exchange factor activity
Ćelijska komponenta citosol
membrana
Biološki proces protein transport
small GTPase mediated signal transduction
membrane fusion
post-Golgi vesicle-mediated transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_002871

NM_145510

RefSeq (bjelančevina)

NP_002862

NP_663485

Lokacija (UCSC)Chr 1: 202.88 – 202.89 MbChr 1: 134.42 – 134.44 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Guaninsko-nukleotidni razmjenski faktor MSS4 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom RABIF sa hromosoma 1.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 123 aminokiseline, a molekulska težina 13.839 Da.[8]

1020304050
MEPAEQPSELVSAEGRNRKAVLCQRCGSRVLQPGTALFSRRQLFLPSMRK
KPALSDGSNPDGDLLQEHWLVEDMFIFENVGFTKDVGNIKFLVCADCEIG
PIGWHCLDDKNSFYVALERVSHE

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Mali GTP-vezujući proteini, povezani sa Sec4/Rab, uključeni su u regulaciju unutarćelijskog vezikulskog transporta. Mss4 stimulira razmjenu GTP-GDP u Sec4 i Rab i veže se za podskup genetički srodnih Rab proteina.[7]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000183155 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042229 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Müller-Pillasch F, Zimmerhackl F, Lacher U, Schultz N, Hameister H, Varga G, Friess H, Büchler M, Adler G, Gress TM (Mar 1998). "Cloning of novel transcripts of the human guanine-nucleotide-exchange factor Mss4: in situ chromosomal mapping and expression in pancreatic cancer". Genomics. 46 (3): 389–96. doi:10.1006/geno.1997.5049. PMID 9441742.
  6. ^ Yu H, Schreiber SL (Aug 1995). "Cloning, Zn2 binding, and structural characterization of the guanine nucleotide exchange factor human Mss4". Biochemistry. 34 (28): 9103–10. CiteSeerX 10.1.1.540.2153. doi:10.1021/bi00028a020. PMID 7619808.
  7. ^ a b "Entrez Gene: RABIF RAB interacting factor".
  8. ^ "UniProt, P47224" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 12. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]