MPHOSPH6

MPHOSPH6
Identifikatori
Aliasi	MPHOSPH6
Vanjski ID-jevi	OMIM: 605500 MGI: 1915783 HomoloGene: 38100 GeneCards: MPHOSPH6
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 16 (čovjek) Bend 16q23.3 Početak 82,147,798 bp Kraj 82,170,224 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 8 (miš) Bend 8|8 E1 Početak 118,518,384 bp Kraj 118,528,682 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje sa RNK Ćelijska komponenta • nuclear exosome (RNase complex) • Jedarce • Egzosomski kompleks • jedro • nukleoplazma • citoplazma Biološki proces • maturation of 5.8S rRNA • rRNA processing Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	10200	68533
Ensembl	ENSG00000135698	ENSMUSG00000031843
UniProt	Q99547	Q9D1Q1
RefSeq (mRNK)	NM_005792	NM_026758 NM_001357232 NM_001357233
RefSeq (bjelančevina)	NP_005783	NP_081034 NP_001344161 NP_001344162
Lokacija (UCSC)	Chr 16: 82.15 – 82.17 Mb	Chr 8: 118.52 – 118.53 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

M-fazni fosfoprotein 6 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MPHOSPH6.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 160 aminokiselina, a molekulska težina 19.024 Da.

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MAAERKTRLS		KNLLRMKFMQ		RGLDSETKKQ		LEEEEKKIIS		EEHWYLDLPE
LKEKESFIIE		EQSFLLCEDL		LYGRMSFRGF		NPEVEKLMLQ		MNAKHKAEEV
EDETVELDVS		DEEMARRYET		LVGTIGKKFA		RKRDHANYEE		DENGDITPIK
AKKMFLKPQD

Kloniranje i ekspresija

Tretiranjem biblioteka za ekspresiju bakterija u citosolu M-faze koji sadrži relevantne kinaze u prisustvu inhibitora fosfataze, nakon čega slijedi imunoskrining s antitijelima MPM2, Matsumoto-Taniura et al. (1996) izolirali su cDNK za brojne MPHOSPH, uključujući MPHOSPH6, koji su nazvali MPP6. Matsumoto-Taniura, N., Pirollet, F., Monroe, R., Gerace, L., Westendorf, J. M. Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Molec. Biol. Cell 7: 1455-1469, 1996. PubMed: 8885239</ref> Imunoblotska analiza pokazala je da se kada se osforilizira, u ćelijama M-faze, MPHOSPH6 eksprimira kao protein od 17 kD. Imunofluorescentna mikroskopija lokalizirala je MPHOSPH6 u čitavom jedru, sa umjerenom koncentracijom u jedarcima, u interfazi i u čitavoj ćeliji tokom mitoze.

Inherentno nestabilne iRNK sisara sadrže elemente bogate AU (ARE) u svojim 3-glavnim neprevedenim regijama. U kvascima, degradaciju iRNK od tri do pet primarnih dijelova posreduje egzon, višejedinična čestica. Chen et al. (2001) pročistili su i okarakterizirali ljudski egzosom masenom spektrometrijom i utvrdili da je njegov sastav sličan kvaščevom. Unutar ljudskog egzozoma, utvrdili su sljedeće proteinske podjedinice:

• p7, koja je homologna proteinu kvasca Rrp4, p8, koji je homologan proteinu kvasca Rrp42;
• p9, koja je homologna proteinu kvasca Rrp43 (OIP2);
• p10, homologna proteinu kvasca Rrp40;
• p11, koja je homologna kvaščevom proteinu Mtr3 ;
• p12A, homolog kvaščevog proteina Rrp41;
• p12B, homologni kvaščevog proteina Rrp46 i
• p13, homolog kvaščevog protein Csl4. Također su identificirali dva faktora povezana s egzosomom, p1 i p14, koji nisu homologni niti jednoj komponenti egzozoma kvasca.

Funkcija gena

Koristeći sistem raspadanja RNK bez ćelija, Chen et al. (2001) pokazali su da je egzosom sisara potreban za brzu razgradnju RNK koja sadrži ARE, ali ne i za skraćivanje poli (A). Otkrili su da egzosom sisara ne prepoznaje RNK koje sadrže ARE. Za prepoznavanje ARE potrebni su određeni proteini koji se vežu za ARE i koji mogu stupiti u interakciju s egzosomom i regrutovati ga u nestabilne RNK, čime se pospješuje njihova brza razgradnja.

Vanjski linkovi

• MPHOSPH6 lokacija ljudskog genoma UCSC Genome Browser.

MPHOSPH6 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.