Idi na sadržaj

Faktor V

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
F5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3S9C, 1CZS, 1CZV, 3P6Z, 3P70

Identifikatori
AliasiF5
Vanjski ID-jeviOMIM: 612309 MGI: 88382 HomoloGene: 104 GeneCards: F5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za F5
Genomska lokacija za F5
Bend1q24.2Početak169,511,951 bp[1]
Kraj169,586,588 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za F5
Genomska lokacija za F5
Bend1 H2.2|1 71.46 cMPočetak163,979,407 bp[2]
Kraj164,047,846 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona metala
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
copper ion binding
Ćelijska komponenta platelet alpha granule
extracellular vesicle
endoplasmic reticulum lumen
membrana
ćelijska membrana
extracellular region
COPII-coated ER to Golgi transport vesicle
endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane
platelet alpha granule lumen
Golđijev aparat
Endoplazmatski retikulum
Golđijeva membrana
Vanćelijsko
Biološki proces Hemostaza
platelet degranulation
Koagulacija (krv)
Krvotok
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
COPII vesicle coating
response to vitamin K
Posttranslacione modifikacije
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000130

NM_007976

RefSeq (bjelančevina)

NP_000121

NP_032002

Lokacija (UCSC)Chr 1: 169.51 – 169.59 MbChr 1: 163.98 – 164.05 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Faktor V (faktor pet) jest protein sistema koagulacije, koji je kod ljudi kodiran genom FV sa hromosoma 1, regija1q24. Rijetko se naziva proakcelerin ili labilni faktor. Za razliku od većine drugih faktora koagulacije, nije enzimski aktivan, ali funkcioniše kao kofaktor. Nedostatak dovodi do predispozicije za hemoragiju, dok neke mutacije (najčešće faktor V Leiden) predisponiraju za trombozu.

Genomski je srodan familiji multibakar-oksidaza i homologan je koagulacijskom faktoru VIII. Gen se prostire na 70 kb, sastoji se od 25 egzona, a rezultirajući protein ima relativnu molekulsku masu od približno 330 kDa.

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 2 224 aminokiseline, a molekulska težina 251.703 Da.

1020304050
MFPGCPRLWVLVVLGTSWVGWGSQGTEAAQLRQFYVAAQGISWSYRPEPT
NSSLNLSVTSFKKIVYREYEPYFKKEKPQSTISGLLGPTLYAEVGDIIKV
HFKNKADKPLSIHPQGIRYSKLSEGASYLDHTFPAEKMDDAVAPGREYTY
EWSISEDSGPTHDDPPCLTHIYYSHENLIEDFNSGLIGPLLICKKGTLTE
GGTQKTFDKQIVLLFAVFDESKSWSQSSSLMYTVNGYVNGTMPDITVCAH
DHISWHLLGMSSGPELFSIHFNGQVLEQNHHKVSAITLVSATSTTANMTV
GPEGKWIISSLTPKHLQAGMQAYIDIKNCPKKTRNLKKITREQRRHMKRW
EYFIAAEEVIWDYAPVIPANMDKKYRSQHLDNFSNQIGKHYKKVMYTQYE
DESFTKHTVNPNMKEDGILGPIIRAQVRDTLKIVFKNMASRPYSIYPHGV
TFSPYEDEVNSSFTSGRNNTMIRAVQPGETYTYKWNILEFDEPTENDAQC
LTRPYYSDVDIMRDIASGLIGLLLICKSRSLDRRGIQRAADIEQQAVFAV
FDENKSWYLEDNINKFCENPDEVKRDDPKFYESNIMSTINGYVPESITTL
GFCFDDTVQWHFCSVGTQNEILTIHFTGHSFIYGKRHEDTLTLFPMRGES
VTVTMDNVGTWMLTSMNSSPRSKKLRLKFRDVKCIPDDDEDSYEIFEPPE
STVMATRKMHDRLEPEDEESDADYDYQNRLAAALGIRSFRNSSLNQEEEE
FNLTALALENGTEFVSSNTDIIVGSNYSSPSNISKFTVNNLAEPQKAPSH
QQATTAGSPLRHLIGKNSVLNSSTAEHSSPYSEDPIEDPLQPDVTGIRLL
SLGAGEFKSQEHAKHKGPKVERDQAAKHRFSWMKLLAHKVGRHLSQDTGS
PSGMRPWEDLPSQDTGSPSRMRPWKDPPSDLLLLKQSNSSKILVGRWHLA
SEKGSYEIIQDTDEDTAVNNWLISPQNASRAWGESTPLANKPGKQSGHPK
FPRVRHKSLQVRQDGGKSRLKKSQFLIKTRKKKKEKHTHHAPLSPRTFHP
LRSEAYNTFSERRLKHSLVLHKSNETSLPTDLNQTLPSMDFGWIASLPDH
NQNSSNDTGQASCPPGLYQTVPPEEHYQTFPIQDPDQMHSTSDPSHRSSS
PELSEMLEYDRSHKSFPTDISQMSPSSEHEVWQTVISPDLSQVTLSPELS
QTNLSPDLSHTTLSPELIQRNLSPALGQMPISPDLSHTTLSPDLSHTTLS
LDLSQTNLSPELSQTNLSPALGQMPLSPDLSHTTLSLDFSQTNLSPELSH
MTLSPELSQTNLSPALGQMPISPDLSHTTLSLDFSQTNLSPELSQTNLSP
ALGQMPLSPDPSHTTLSLDLSQTNLSPELSQTNLSPDLSEMPLFADLSQI
PLTPDLDQMTLSPDLGETDLSPNFGQMSLSPDLSQVTLSPDISDTTLLPD
LSQISPPPDLDQIFYPSESSQSLLLQEFNESFPYPDLGQMPSPSSPTLND
TFLSKEFNPLVIVGLSKDGTDYIEIIPKEEVQSSEDDYAEIDYVPYDDPY
KTDVRTNINSSRDPDNIAAWYLRSNNGNRRNYYIAAEEISWDYSEFVQRE
TDIEDSDDIPEDTTYKKVVFRKYLDSTFTKRDPRGEYEEHLGILGPIIRA
EVDDVIQVRFKNLASRPYSLHAHGLSYEKSSEGKTYEDDSPEWFKEDNAV
QPNSSYTYVWHATERSGPESPGSACRAWAYYSAVNPEKDIHSGLIGPLLI
CQKGILHKDSNMPMDMREFVLLFMTFDEKKSWYYEKKSRSSWRLTSSEMK
KSHEFHAINGMIYSLPGLKMYEQEWVRLHLLNIGGSQDIHVVHFHGQTLL
ENGNKQHQLGVWPLLPGSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPF
LIMDRDCRMPMGLSTGIISDSQIKASEFLGYWEPRLARLNNGGSYNAWSV
EKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGIQTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSN
QINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPIVARYIRISPTRAYN
RPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPFR
ARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYV
KSYTIHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRF
IRVIPKTWNQSIALRLELFGCDIY

Struktura

[uredi | uredi izvor]

Protein faktora V sastoji se od šest domena: A1-A2-B-A3-C1-C2.

A domeni su homologni sa A domenima proteina koji vezuje bakar ni ceruloplazmin i formiraju trouglastu strukturu kao u tom proteinu. Ion bakra je vezan na interfejsu A1-A3, a A3 je u interakciji sa plazmom.[5]

C-domeni pripadaju porodici fosfolipid-vezujućih diskoidinskih domena (nije u vezi sa C2-domenom), a C2-domen posreduje u vezivanju membrane. B-domen C-terminala deluje kao kofaktor za antikoagulansni protein C aktivirajući protein S.[6][7]

Aktivacija faktora V u faktor Va vrši se cijepanjem i oslobađanjem B-domena, nakon čega protein više ne pomaže u aktivaciji proteina C. Protein je sada podijeljen na teški lanac koji se sastoji od A1-A2 domena i lahki lanac, koji se sastoji od A3-C1-C2 domena. Oba nekovalentno formiraju kompleks na način ovisan o kalciju. Ovaj kompleks je prokoagulantni faktor Va.[6]

Fiziologija

[uredi | uredi izvor]

Sinteza faktora V se uglavnom odvija u jetri. U jetri ga prvenstveno proizvode megakariociti, koji proizvode trombocite i faktor V koji potiče od trombocita, i hepatociti, koji proizvode faktor V iz plazme.[8] Molekula cirkuliše u plazmi kao jednolančana molekula sa poluživotom u plazmi od 12-36 sati.[9]

Faktor V je u stanju da se veže za aktivirane trombocite i aktivira ga trombin. Prilikom aktivacije, faktor V se spaja u dva lanca (teški i lahki lanac sa molekulskom masom od 110000 i 73000) koji su nekovalentno vezani jedan za drugi pomoću kalcija. Time aktivirani faktor V (sada zvani FVa) je kofaktor kompleksa protrombinaza: Aktivirani enzimski faktor X (FXa) zahtijeva kalcij i aktivirani faktor V (FVa) za pretvaranje protrombina u trombin na površine ćelijske membrane.

Faktor Va razgrađuje aktivirani protein C, jedan od glavnih fizioloških inhibitora koagulacije. U prisustvu trombomodulina, trombin djeluje na smanjenje zgrušavanja tako što aktivira protein C; stoga su koncentracija i djelovanje proteina C važne determinante u negativnoj povratnoj sprezi kroz koju trombin ograničava vlastitu aktivaciju.

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Poznati su različiti nasljedni poremećaji faktora V. Nedostatak je povezan s rijetkim blagim oblikom hemofilije (koji se naziva parahemofilija ili Owrenova parahemofilija), čija je incidencija oko 1:1.000.000. Nasljeđuje se na autosomno recesivno način.

Postoji tendencija krvarenja povezana s genetičkom regulacijom skraćenog FV, manje izoforme FV za preradu. Ova abnormalna tendencija krvarenja javlja se kod poremećaja krvarenja u istočnom Teksasu, poremećaja krvarenja u Amsterdamu i trećeg i ekstremnijeg primjera koji su opisali Karen L. Zimowski et al., 2021.[10]

Ostale mutacije faktora V povezane su sa venskom trombozom. Oni su najčešći nasljedni uzroci trombofilije (sklonost stvaranju krvnih ugrušaka). Najčešći od njih, faktor V Leiden, nastaje zbog zamjene argininskog ostatka sa glutaminom na aminokiselinskoj poziciji 506 (R506Q). Sve protrombotske mutacije faktora V (faktor V Leiden, faktor V Cambridge, faktor V Hong Kong) čine ga otpornim na cijepanje aktiviranim proteinom C („APC rezistencija“). Stoga ostaje aktivan i povećava brzinu stvaranja trombina.

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da faktor V reaguje sa proteinom S.[11][12]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198734 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026579 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Villoutreix BO, Björn Dahlbäck (juni 1998). "Structural investigation of the A domains of human blood coagulation factor V by molecular modeling". Protein Science. 7 (6): 1317–25. doi:10.1002/pro.5560070607. PMC 2144041. PMID 9655335. Greška u vankuverskom stilu: name u nazivu 2 (pomoć)
  6. ^ a b Thorelli E, Kaufman RJ, Dahlbäck B (juni 1998). "The C-terminal region of the factor V B-domain is crucial for the anticoagulant activity of factor V". The Journal of Biological Chemistry. 273 (26): 16140–45. doi:10.1074/jbc.273.26.16140. PMID 9632668.
  7. ^ Macedo-Ribeiro S, Bode W, Huber R, Quinn-Allen MA, Kim SW, Ortel TL, Bourenkov GP, Bartunik HD, Stubbs MT, Kane WH, Fuentes-Prior P (novembar 1999). "Crystal structures of the membrane-binding C2 domain of human coagulation factor V". Nature. 402 (6760): 434–39. Bibcode:1999Natur.402..434M. doi:10.1038/46863. PMID 10586886. S2CID 4393638.
  8. ^ Lam W, Moosavi L (18. 7. 2022). "Physiology, Factor V". StatPearls. StatPearls Publishing. Pristupljeno 7. 2. 2022.
  9. ^ Huang JN, Koerper MA (novembar 2008). "Factor V deficiency: a concise review". Haemophilia. 14 (6): 1164–69. doi:10.1111/j.1365-2516.2008.01785.x. PMID 19141156.
  10. ^ Castoldi E (juli 2021). "F5-Atlanta: Factor V-short strikes again". Journal of Thrombosis and Haemostasis. 19 (7): 1638–1640. doi:10.1111/jth.15351. PMC 8362210 Provjerite vrijednost parametra |pmc= (pomoć). PMID 34176223 Provjerite vrijednost parametra |pmid= (pomoć).
  11. ^ Heeb MJ, Kojima Y, Rosing J, Tans G, Griffin JH (decembar 1999). "C-terminal residues 621–635 of protein S are essential for binding to factor Va". The Journal of Biological Chemistry. 274 (51): 36187–92. doi:10.1074/jbc.274.51.36187. PMID 10593904.
  12. ^ Heeb MJ, Mesters RM, Tans G, Rosing J, Griffin JH (februar 1993). "Binding of protein S to factor Va associated with inhibition of prothrombinase that is independent of activated protein C". The Journal of Biological Chemistry. 268 (4): 2872–77. doi:10.1016/S0021-9258(18)53854-0. PMID 8428962.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]