Idi na sadržaj

AFF3

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
AFF3
Identifikatori
AliasiAFF3
Vanjski ID-jeviOMIM: 601464 MGI: 106927 HomoloGene: 1718 GeneCards: AFF3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za AFF3
Genomska lokacija za AFF3
Bend2q11.2Početak99,545,419 bp[1]
Kraj100,192,428 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za AFF3
Genomska lokacija za AFF3
Bend1 B|1 16.58 cMPočetak38,216,407 bp[2]
Kraj38,704,036 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
double-stranded DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Ćelijska komponenta jedro
nukleoplazma
citosol
nuclear body
transcription elongation factor complex
super elongation complex
Biološki proces response to tumor necrosis factor
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
embryonic hindlimb morphogenesis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001025108
NM_002285
NM_001386135

NM_001290814
NM_010678

RefSeq (bjelančevina)

NP_001020279
NP_002276

NP_001277743

Lokacija (UCSC)Chr 2: 99.55 – 100.19 MbChr 1: 38.22 – 38.7 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Član 3 porodice proteina AF4/FMR2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom AFF3 sa hromosoma 3.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.226 aminokiselina, а molekulska težina 133.476 Da.[8]

1020304050
MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSY
SLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGV
PQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQK
AGHPPSDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPP
AMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPK
LKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNS
CVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGD
AEPESPDSGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQ
PNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKP
PHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPV
KEDVQDCGKVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSP
PAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGA
NCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKR
RTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASA
SSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGR
NELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESA
PPSHTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTS
NTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSS
RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQT
KPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGK
ALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSG
PNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKA
AQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSI
PQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT
LHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira tkivno ograničeni jedarni transkripcijski aktivator koji se prvenstveno eksprimira u limfoidnom tkivu. Izolacija ovog proteina je prvobitno definirala visoko konzerviranu porodicu gena LAF4/MLLT2 jedarnih transkripcijskih faktora koji mogu funkcionirati u razvoju limfoida i onkogenezi. Kod nekih pacijenata sa akutnom limfoblastnom leukemijom , ovaj gen je pronađen spojen sa genom za mijeloidnu/limfoidnu ili mešovitu leukemiju. Za ovaj gen je pronađeno više alternativno prerađnih varijanti transkriptakoje kodiraju različite proteinske izoforme.[7]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000144218 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037138 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Liao X, Ma C, Trask B, Massa H, Gilbert DJ, Staudt LM, Jenkins NA, Copeland NG (Jun 1996). "LAF4 maps to mouse chromosome 1 and human chromosome 2q11.2-q12". Mammalian Genome. 7 (6): 467–8. doi:10.1007/s003359900137. PMID 8662235. S2CID 1525532.
  6. ^ Ma C, Staudt LM (Jan 1996). "LAF-4 encodes a lymphoid nuclear protein with transactivation potential that is homologous to AF-4, the gene fused to MLL in t(4;11) leukemias". Blood. 87 (2): 734–45. doi:10.1182/blood.V87.2.734.bloodjournal872734. PMID 8555498.
  7. ^ a b "Entrez Gene: AFF3 AF4/FMR2 family, member 3".
  8. ^ "UniProt, P51826" (jezik: engleski). Pristupljeno 10. 11. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]