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adjacency_matrix.cpp
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// This file is part of libigl, a simple c geometry processing library.
//
// Copyright (C) 2013 Alec Jacobson <[email protected]>
//
// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License
// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can
// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
#include "adjacency_matrix.h"
#include "verbose.h"
#include <vector>
template <typename DerivedF, typename T>
IGL_INLINE void igl::adjacency_matrix(
const Eigen::MatrixBase<DerivedF> & F,
Eigen::SparseMatrix<T>& A)
{
using namespace std;
using namespace Eigen;
typedef typename DerivedF::Scalar Index;
typedef Triplet<T> IJV;
vector<IJV > ijv;
ijv.reserve(F.size()*2);
// Loop over **simplex** (i.e., **not quad**)
for(int i = 0;i<F.rows();i )
{
// Loop over this **simplex**
for(int j = 0;j<F.cols();j )
for(int k = j 1;k<F.cols();k )
{
// Get indices of edge: s --> d
Index s = F(i,j);
Index d = F(i,k);
ijv.push_back(IJV(s,d,1));
ijv.push_back(IJV(d,s,1));
}
}
const Index n = F.maxCoeff() 1;
A.resize(n,n);
switch(F.cols())
{
case 3:
A.reserve(6*(F.maxCoeff() 1));
break;
case 4:
A.reserve(26*(F.maxCoeff() 1));
break;
}
A.setFromTriplets(ijv.begin(),ijv.end());
// Force all non-zeros to be one
// Iterate over outside
for(int k=0; k<A.outerSize(); k)
{
// Iterate over inside
for(typename Eigen::SparseMatrix<T>::InnerIterator it (A,k); it; it)
{
assert(it.value() != 0);
A.coeffRef(it.row(),it.col()) = 1;
}
}
}
template <typename DerivedI, typename DerivedC, typename T>
IGL_INLINE void igl::adjacency_matrix(
const Eigen::MatrixBase<DerivedI> & I,
const Eigen::MatrixBase<DerivedC> & C,
Eigen::SparseMatrix<T>& A)
{
using namespace std;
using namespace Eigen;
typedef Triplet<T> IJV;
vector<IJV > ijv;
ijv.reserve(C(C.size()-1)*2);
typedef typename DerivedI::Scalar Index;
const Index n = I.maxCoeff() 1;
{
// loop over polygons
for(Index p = 0;p<C.size()-1;p )
{
// number of edges
const Index np = C(p 1)-C(p);
// loop over edges
for(Index c = 0;c<np;c )
{
const Index i = I(C(p) c);
const Index j = I(C(p) ((c 1)%np));
ijv.emplace_back(i,j,1);
ijv.emplace_back(j,i,1);
}
}
}
A.resize(n,n);
A.reserve(6*n);
A.setFromTriplets(ijv.begin(),ijv.end());
// Force all non-zeros to be one
// Iterate over outside
for(int k=0; k<A.outerSize(); k)
{
// Iterate over inside
for(typename Eigen::SparseMatrix<T>::InnerIterator it (A,k); it; it)
{
assert(it.value() != 0);
A.coeffRef(it.row(),it.col()) = 1;
}
}
}
#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
// Explicit template instantiation
template void igl::adjacency_matrix<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::SparseMatrix<int, 0, int>& );
// generated by autoexplicit.sh
template void igl::adjacency_matrix<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, bool>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::SparseMatrix<bool, 0, int>&);
template void igl::adjacency_matrix<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>&);
template void igl::adjacency_matrix<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::SparseMatrix<int, 0, int>&);
template void igl::adjacency_matrix<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3>, int>(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::SparseMatrix<int, 0, int>&);
#endif