PABPC1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PABPC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poly(A) binding protein cytoplasmic 1
Зовнішні ІД OMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 GeneCards: PABPC1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002568
NM_008774
RefSeq (білок)
NP_002559
NP_032800
Локус (UCSC) Хр. 8: 100.69 – 100.72 Mb Хр. 15: 36.6 – 36.61 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PABPC1 (англ. Poly(A) binding protein cytoplasmic 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 636 амінокислот, а молекулярна маса — 70 671[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNPSAPSYPMASLYVGDLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVCRDMITRR
SLGYAYVNFQQPADAERALDTMNFDVIKGKPVRIMWSQRDPSLRKSGVGN
IFIKNLDKSIDNKALYDTFSAFGNILSCKVVCDENGSKGYGFVHFETQEA
AERAIEKMNGMLLNDRKVFVGRFKSRKEREAELGARAKEFTNVYIKNFGE
DMDDERLKDLFGKFGPALSVKVMTDESGKSKGFGFVSFERHEDAQKAVDE
MNGKELNGKQIYVGRAQKKVERQTELKRKFEQMKQDRITRYQGVNLYVKN
LDDGIDDERLRKEFSPFGTITSAKVMMEGGRSKGFGFVCFSSPEEATKAV
TEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPY
QPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNM
PGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAA
ATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASML
ASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESP
ESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Grange T., de Sa C.M., Oddos J., Pictet R. (1987). Human mRNA polyadenylate binding protein: evolutionary conservation of a nucleic acid binding motif. Nucleic Acids Res. 15: 4771—4787. PMID 2885805 DOI:10.1093/nar/15.12.4771
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Goerlach M., Burd C.G., Dreyfuss G. (1994). The mRNA poly(A)-binding protein: localization, abundance, and RNA-binding specificity. Exp. Cell Res. 211: 400—407. PMID 7908267 DOI:10.1006/excr.1994.1104
  • Afonina E., Stauber R., Pavlakis G.N. (1998). The human poly(A)-binding protein 1 shuttles between the nucleus and the cytoplasm. J. Biol. Chem. 273: 13015—13021. PMID 9582337 DOI:10.1074/jbc.273.21.13015
  • Craig A.W.B., Haghighat A., Yu A.T.K., Sonenberg N. (1998). Interaction of polyadenylate-binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation. Nature. 392: 520—523. PMID 9548260 DOI:10.1038/33198
  • Lee J., Bedford M.T. (2002). PABP1 identified as an arginine methyltransferase substrate using high-density protein arrays. EMBO Rep. 3: 268—273. PMID 11850402 DOI:10.1093/embo-reports/kvf052

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]