Løbet startede med en enkeltstart i Monaco. Etapen blev delvis kørt på den kendte racerbane Circuit de Monaco i Monte Carlo. Etapen blev vundet af Fabian Cancellara som derefter kunne køre 6 dage i den gule førertrøje. Næste etape startede også i Monaco. Det er sjette gang Tour de France besøger Monaco, forrige gang var i 1964.
I alperne forsøgte især Schleck-brødrene Andy og Fränk at angribe Contador, men den spanske bjergrytter forsvarede føringen. På Champs-Élysées kunne Contador stige op på podiet som vinder af sit andet Tour de France til tonerne af Der er et yndigt land. Den danske nationalmelodi blev fejlagtigt spillet i stedet for den spanske, der dog blev spillet kort efter, efter dyb beklagelse fra ledelsen. Andy Schleck fik andenpladsen, mens britenBradley Wiggins blev nr. 3, efter den oprindelige treer Lance Armstrong fik frataget resultatet.
Samlet var løbet 3445 kilometer, inkluderet 93 km fordelt på to individuelle enkeltstarter og en holdtidskørsel. Det var første gang siden 2005 at der stod holdtidskørsel på programmet. Der var syv bjergetaper, tre af dem med målstreg på toppen. For første gang i historien blev den næstsidste etape afsluttet med målstreg på et bjerg, Mont Ventoux.
Alle de fire tidligere ryttere der har vundet løbet samlet de sidste ti år stiller til start: Lance Armstrong(1999-2005) [alle resultater slettede], Óscar Pereiro Sio (2006), Alberto Contador (2007) og Carlos Sastre (2008). Totalt er der 180 ryttere fra 30 nationer.
1. juli: Thomas Dekker (SIL) testet positiv for EPO, efter at en prøve fra 2007 blev testet på ny på grund af uregelmæssigheder i blodværdierne baseret på prøver taget til Dekkers biologiske pas. Dette skete 3 dage før løbet gik i gang.[2]
31. juli: Mikel Astarloza (Euskaltel-Euskadi), som blev vinder af 16. etape af årets Tour de France, er blevet testet positiv for brug af epo. Dette skete allerede den 26. juni – over en uge inden at TDF2009 startede. Han er blevet frataget sejren fra 16. etape, og den går dermed til franske Sandy Casar.
.jpg)
Frankrig
Monaco
Spanien
Andorra
Schweiz
Italien
Andy Schleck (Saxo Bank).svg){kind=small}
Bradley Wiggins (Garmin-Slipstream)
Thor Hushovd (Cervélo TestTeam)
Astana
_pictogram.svg){kind=small}
Uddybende artikel: Ryttere og hold i Tour de France 2009
Frankrig
Spanien
Italien, 
Tyskland
Belgien, 
Holland
Rusland
USA
Australien
Storbritannien
Danmark, 
Luxembourg, 
Schweiz
Colombia, 
Hviderusland, 
Japan, 
New Zealand, 
Norge, 
Portugal, 
Ukraine, 
Østrig
Canada, 
Finland, 
Irland, 
Kasakhstan, 
Polen, 
Slovakiet, 
Slovenien, 
Sverige, 
Tjekkiet
